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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G003094`

染色体: Chr06 坐标: 43800368-43805304 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G003094`
名称	SmilChr06G003094
描述	proline-rich receptor-like protein kinase PERK8
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	43800368 - 43805304 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989820`
GeneID	`130989820`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989820`
原始查询	`SmilChr06G003094`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	proline-rich receptor-like protein kinase PERK8
产物	proline-rich receptor-like protein kinase PERK8
Arabidopsis	`AT1G68690` (PERK9) Protein kinase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3767664] identity=62.5; qcov=0.619; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0110500` - identity=54.9; qcov=0.873; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989820

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057769910.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057769910.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769910.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057769910.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057769910.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:43801441`	`TGA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B125
`Chr6:43801441`	`TGA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B125
`Chr6:43801473`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B120
`Chr6:43801473`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B120
`Chr6:43801503`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B109,B131,B36,C15
`Chr6:43801516`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A19
`Chr6:43801549`	`ACC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C86
`Chr6:43801549`	`ACC`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C86
`Chr6:43801552`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C86
`Chr6:43801552`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C86
`Chr6:43801597`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B39,B88,C8
`Chr6:43801603`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769910.1

703 aa

352

703

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF00069 Pkinase 372-578 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 374-645 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769910.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	372	578	3.6e-42	145.3	Protein kinase domain
`XP_057769910.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	374	645	6.8e-44	150.8	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913927.1
GAAGGCAACAAATTTATTTTATTTTATTAAAAAAGCAAAGCGAAATTTACAAATGATTGAATGGTTGAAGTAGGCAGGGAGAGCTGTGAACATGGCGTTCATGATGATGATGTTTCTGTTTGACTTGGCTGCTTCGTAACGTTCTCTCTTCAATACTATATTCATATTTCCCACCACCTTCACCTTCGCCTTCACATTCAGATTTATTCTCTACCAGATACTTGTTTTTTTTAATCCAAATAATTATTTTTTGACAGAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989820
ATGGCTTCAATTATACCAATTCCTTTACCATCAATTCCTCCAACAAATTCCATTCCTCCTTCAGGGTCTAATGCTAATCAGACAACTGACACACCACCCCCTTCAGCCTCTCCTCCTCCATCTACTCCCTCTCCTCCACCTCCGGAGTCGGCTCCACCGCCGTCTCCTTCTGCCCCTCCTCCATCCCCACCACAACCTCCTCCTCCAGAAACACCACCACCTGCATTGCCTTCTACACCACCCCCTTCGCCCCCACCATC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769910.1
MASIIPIPLPSIPPTNSIPPSGSNANQTTDTPPPSASPPPSTPSPPPPESAPPPSPSAPPPSPPQPPPPETPPPALPSTPPPSPPPSPPSPVSPPPSPPTAPPPAANSPPPPAVSPPPPSGGSPPEESPAPPAISPSPPPPAAEAAPPTTSPPPPPAAHSPKHSPPPPTSPPPQIGSPPIPPTSSPPPAATASPPPTPSSSLSPSISPPAPPYNTSNNGSLPASPLPSLPGSPLPSLPTEKPTAGSTQHSPNITADVTSR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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