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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G003096`

染色体: Chr06 坐标: 43812001-43817656 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G003096`
名称	SmilChr06G003096
描述	isoprenylcysteine alpha-carbonyl methylesterase ICME
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	43812001 - 43817656 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989822`
GeneID	`130989822`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989822`
原始查询	`SmilChr06G003096`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	isoprenylcysteine alpha-carbonyl methylesterase ICME
产物	isoprenylcysteine alpha-carbonyl methylesterase ICME
Arabidopsis	`AT5G15860` (PCME) prenylcysteine methylesterase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831443] identity=69.7; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0708100` (IMCEL1) - identity=67.2; qcov=0.861; evalue=4.37e-178; confidence=high
GO	-
KEGG	smil00900 (Terpenoid backbone biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00135 (COesterase); PF00326 (Peptidase_S9); PF07859 (Abhydrolase_3); PF20434 (BD-FAE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989822

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.80000	`XP_057769913.1`
2	Golgi apparatus	高尔基体	0.60000	`XP_057769913.1`
3	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.40000	`XP_057769913.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057769913.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769913.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:43814595`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C44
`Chr6:43815428`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B136
`Chr6:43816429`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr6:43816630`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:43817008`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C17
`Chr6:43817056`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93
`Chr6:43817242`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769913.1

425 aa

212

425

COesterase

BD-FAE

Abhydrolase_3

Peptidase_S9

PF00135 COesterase 141-265 aa PF20434 BD-FAE 141-349 aa PF07859 Abhydrolase_3 156-366 aa PF00326 Peptidase_S9 315-366 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769913.1`	Pfam	`PF00135`	COesterase	Domain	141	265	1.7e-12	47.8	Carboxylesterase family
`XP_057769913.1`	Pfam	`PF20434`	BD-FAE	Domain	141	349	1.8e-25	90.5	BD-FAE
`XP_057769913.1`	Pfam	`PF07859`	Abhydrolase_3	Domain	156	366	6.3e-15	56.2	alpha/beta hydrolase fold
`XP_057769913.1`	Pfam	`PF00326`	Peptidase_S9	Domain	315	366	4.4e-07	30.3	Prolyl oligopeptidase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913930.1
ATAGAGGGATTTGGGAGAGGTTAGTTAGTTGTCAGCGAAGGCGCCACTTCTACATTGCCAAAAATGACTATTTCATTCAAAATTCAACCGCTGTATCATCAAATCGAAATAAACAGATAAAATCTCGCTCTTCGCAAATCGCAGATTGCTTCACGCCGCCCAATGCAATGCGACAATATTCTGCATCATTTTGCTAATCCCCATAAAATCCGACACCCTCTCAATCCTAAATTTACAATCTCGATTCTCCAAATCTCCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989822
ATGGAATCGCCGCTGTCGCCGGAGAATCGCCCTCCCGGAGATTCCGTCGATGAGATTACCGAAGAAAATGAAGCCGACGCTCTGGTTAGCGCCTCGAGTTTCAAAGGTGCTTCTCTGAATCAGCAACAGAGGCGGAGGCGCGGCGGCAATAAGACGACGCCGTTTGCGGCTCCGCCGTGCCGTCAGCAGTCGTTCAGCCGTGAGATCGGCCACGCTGCTGCCGAGACTTACCTGCTCACTCGCCTCAGCTTCAAGCTGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769913.1
MESPLSPENRPPGDSVDEITEENEADALVSASSFKGASLNQQQRRRRGGNKTTPFAAPPCRQQSFSREIGHAAAETYLLTRLSFKLLSYLGVGYRWITRLLALALYAMLLMPGFIQVAFHYYFSSQVRRSIVYGDQPRNRLDLYLPRNSDGLKPVVIFVTGGAWIIGYKAWGALLGLQLAERDIIVACLDYRNFPQGTISDMVRDVCQGISVICNHIAELGGDPKKIYLMGQSAGAHISSCALLQQAVKESKGESIYWSP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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