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同源 qcov 为最佳单个 HSP 在查询序列上的坐标跨度／序列长度；置信度是规则分级，不是已验证的正交关系。

Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；未闭环名称仅提供候选导航。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。
示例

当前解析结果

SmilChr06G003098

染色体: Chr06 坐标: 43822874-43827718 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene IDSmilChr06G003098
名称SmilChr06G003098
描述uncharacterized SmilChr06G003098
染色体 / SeqIDChr06 / NC_080392.1
坐标与链方向43822874 - 43827718 / +

ID 对照

NCBI Gene IDLOC130989824
GeneID130989824
locus_tag-
NCBI NameLOC130989824
原始查询SmilChr06G003098

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述Proline-rich spliceosome-associated (PSP) family protein / zinc knuckle (CCHC-type) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833850]; symbol=AT5G38600; hit=AT5G38600; species=arabidopsis; confidence=medium
产物Proline-rich spliceosome-associated (PSP) family protein / zinc knuckle (CCHC-type) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833850]; symbol=AT5G38600; hit=AT5G38600; species=arabidopsis; confidence=medium
ArabidopsisAT5G38600 (AT5G38600)
Proline-rich spliceosome-associated (PSP) family protein / zinc knuckle (CCHC-type) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833850]
identity=43.61; qcov=0.961; evalue=1.68e-121; confidence=medium
RiceOs06g0495700
-
identity=47.03; qcov=0.799; evalue=3.89e-107; confidence=high
GOGO:0003723 (RNA binding); GO:0008270 (zinc ion binding); GO:0034470 (GO:0034470); GO:0071013 (catalytic step 2 spliceosome)
KEGG-
PfamPF04046 (PSP)
InterPro-
eggNOG-
NRGeneID:130989824

打开注释模块

非零投票定位候选（最多五项）

Rank定位位置中文五折投票比例Protein ID
1 Nucleus 细胞核 1.00000 XP_057769915.1

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置 REF ALT 类型 影响 携带材料数 材料
Chr6:43824008 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 B134
Chr6:43824009 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 D10
Chr6:43824070 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 3 B100,B124,B31
Chr6:43824185 C CCG 2bp_insertion frameshift_variant 72 A13,A14,A15,A2,A23,A25,A5,B100,B101,B103,B104,B109,B111,B113,B115,B119,B12,B120,B124,B125,B134,B135,B136,B140,B20,B22,B23,B26,B28,B31,B32,B35,B36,B45,B5,B50,B51,B53,B56,B59,B64,B72,B73,B79,B83,B86,B90,B91,B93,B94,B96,B97,C25,C28,C34,C39,C45,C47,C48,C59,C61,C65,C75,C76,C8,C82,C84,C87,C9,D10,D2,D8
Chr6:43824187 GCA G 2bp_deletion frameshift_variant 72 A13,A14,A15,A2,A23,A25,A5,B100,B101,B103,B104,B109,B111,B113,B115,B119,B12,B120,B124,B125,B134,B135,B136,B140,B20,B22,B23,B26,B28,B31,B32,B35,B36,B45,B5,B50,B51,B53,B56,B59,B64,B72,B73,B79,B83,B86,B90,B91,B93,B94,B96,B97,C25,C28,C34,C39,C45,C47,C48,C59,C61,C65,C75,C76,C8,C82,C84,C87,C9,D10,D2,D8
Chr6:43824213 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 2 A23,C84
Chr6:43824273 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 4 B13,C23,C27,C82
Chr6:43824284 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 2 A23,C84
Chr6:43824917 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 3 B42,B43,B76
Chr6:43826434 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 B71
Chr6:43826608 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 3 A20,B77,B8
Chr6:43826642 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 B37

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769915.1
543 aa
N
1
272
543
PSP
C
PF04046 PSP 331-368 aa
XP_057769916.1
543 aa
N
1
272
543
PSP
C
PF04046 PSP 331-368 aa
XP_057769917.1
503 aa
N
1
252
503
PSP
C
PF04046 PSP 291-328 aa
XP_057769918.1
503 aa
N
1
252
503
PSP
C
PF04046 PSP 291-328 aa
Protein ID 来源 结构域编号 结构域名称 类型 起始 aa 终止 aa E-value Score 说明
XP_057769915.1 Pfam PF04046 PSP Family 331 368 4.7e-13 49.4 PSP
XP_057769916.1 Pfam PF04046 PSP Family 331 368 4.7e-13 49.4 PSP
XP_057769917.1 Pfam PF04046 PSP Family 291 328 4.2e-13 49.5 PSP
XP_057769918.1 Pfam PF04046 PSP Family 291 328 4.2e-13 49.5 PSP

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA
XM_057913932.1
ATGTGCAATTAATTTTGTTACGTTCTCAAATTATAATTTATAATTTCCAAAAATAGATTGTAGTATAGAAATTTAGAATTATAAGTGCGCGGGTTAGGTTGTTGGCAATCTAAAAGAGAATGATTATTTAGTGATAAATGAGTTGCATTATCGACAAATAAAAACCAATAAATATTCCAAAGCTCTGCGCAGACCTTTGGGATCCCAAATTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCTCCTCACGCGCAC...
XM_057913934.1
GTTGGCAATCTAAAAGAGAATGATTATTTAGTGATAAATGAGTTGCATTATCGACAAATAAAAACCAATAAATATTCCAAAGCTCTGCGCAGACCTTTGGGATCCCAAATTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCTCCTCACGCGCACACACAGATTTATCTCCTAAATTTTCAAAATCTTGGCGCTACAGACCAAGCTTGGTTTCCAAATCTCAATTCCGGCGGCGGTGCCCATCCCAGCATCGATA...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA
lcl|NC_080392.1_cds_XP_057769915.1_34021
ATGGAAACGGAGGATCTAATCAAACTGCCTGCTTCCAGTAATTCAGAACATGGTGAGAATGACAATACATGTGAATCTGGTTCGGAAGCCATTAACTCTGAATCTCTGCCTCTAAACTCTAAGGTAACCGAAGAGATTCATGGGGAGGATCCTGGAGCCATTTTGGGTGTTTTGGATGAAAATATGGATGCTCTGATGGAGGATGACTTTGAAAGGGGTCCAAATAGTAATGCCGTGACCCCACCCATTGGTTTGGAAAT...
lcl|NC_080392.1_cds_XP_057769916.1_34022
ATGGAAACGGAGGATCTAATCAAACTGCCTGCTTCCAGTAATTCAGAACATGGTGAGAATGACAATACATGTGAATCTGGTTCGGAAGCCATTAACTCTGAATCTCTGCCTCTAAACTCTAAGGTAACCGAAGAGATTCATGGGGAGGATCCTGGAGCCATTTTGGGTGTTTTGGATGAAAATATGGATGCTCTGATGGAGGATGACTTTGAAAGGGGTCCAAATAGTAATGCCGTGACCCCACCCATTGGTTTGGAAAT...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA
XP_057769915.1
METEDLIKLPASSNSEHGENDNTCESGSEAINSESLPLNSKVTEEIHGEDPGAILGVLDENMDALMEDDFERGPNSNAVTPPIGLEITDSVADVEKVVSVRSAHRGNGFLSVQSEINVGNLKKNEVLSSKREIDANSMSGVKRPRVAFEEQQPSVHVIYSSLPRESKQKLEKLLEQWSQWHSQWSSTSDDSNVVLESGEETYFPALRVGGDKPSSITFWVDNQTKMQSSKEFRQLDSSSVPLYDRGYSSALTSTDGGSGL...
XP_057769916.1
METEDLIKLPASSNSEHGENDNTCESGSEAINSESLPLNSKVTEEIHGEDPGAILGVLDENMDALMEDDFERGPNSNAVTPPIGLEITDSVADVEKVVSVRSAHRGNGFLSVQSEINVGNLKKNEVLSSKREIDANSMSGVKRPRVAFEEQQPSVHVIYSSLPRESKQKLEKLLEQWSQWHSQWSSTSDDSNVVLESGEETYFPALRVGGDKPSSITFWVDNQTKMQSSKEFRQLDSSSVPLYDRGYSSALTSTDGGSGL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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