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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G003106`

染色体: Chr06 坐标: 43913624-43916422 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G003106`
名称	SmilChr06G003106
描述	glucan endo-1,3-beta-glucosidase-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	43913624 - 43916422 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989832`
GeneID	`130989832`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989832`
原始查询	`SmilChr06G003106`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	glucan endo-1,3-beta-glucosidase-like
产物	glucan endo-1%2C3-beta-glucosidase-like
Arabidopsis	`AT4G09465` (AT4G09465) Carbohydrate-binding X8 domain superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:5008130] identity=47.9; qcov=0.85; evalue=4.48e-27; confidence=medium
Rice	`Os11g0704600` - identity=42.2; qcov=0.735; evalue=8.29e-19; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF07983 (X8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989832

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057769938.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057769938.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769938.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057769938.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057769938.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:43915179`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B108
`Chr6:43915179`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B108
`Chr6:43915932`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46
`Chr6:43916266`	`A`	`ATT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B104
`Chr6:43916266`	`A`	`ATT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B104
`Chr6:43916283`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr6:43916299`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769938.1

113 aa

113

PF07983 X8 34-91 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769938.1`	Pfam	`PF07983`	X8	Domain	34	91	1.1e-14	55.5	X8 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913955.1
CCAATTCTCAATTTTCAAACACCACCAAAAATCTCAAACAAAATTGAAGCAAAACCACATAACAATACACATCCACTCTCCAAAGATGAAACTCTCTTTGTTCATCGTCATGTTTCAACTAGGGTTTGTCATCTCCTACGTCGCTGCACACTCCATTTCTCATGCAGTGATTCACCAGAGCAAAACATGGTGTGTGGTGACAGTAGGAGCACCCAACGACAAGCTGCAAGCATTTTTGGATTCAACGTGCAATGAATTGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989832
ATGAAACTCTCTTTGTTCATCGTCATGTTTCAACTAGGGTTTGTCATCTCCTACGTCGCTGCACACTCCATTTCTCATGCAGTGATTCACCAGAGCAAAACATGGTGTGTGGTGACAGTAGGAGCACCCAACGACAAGCTGCAAGCATTTTTGGATTCAACGTGCAATGAATTGGATTGCAAAGCAATAAGACCAGGTGGTTCTTGCTATCAACCAAATACGTTGCAGAATCATGCATCCTTCGTTCTCAATCTCTTCTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769938.1
MKLSLFIVMFQLGFVISYVAAHSISHAVIHQSKTWCVVTVGAPNDKLQAFLDSTCNELDCKAIRPGGSCYQPNTLQNHASFVLNLFYRARGVCNSELGTPSVNDPSFGKCIYS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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