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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G003116`

染色体: Chr06 坐标: 44007832-44009843 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G003116`
名称	SmilChr06G003116
描述	lysM domain receptor-like kinase 4
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	44007832 - 44009843 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989842`
GeneID	`130989842`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989842`
原始查询	`SmilChr06G003116`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	lysM domain receptor-like kinase 4
产物	lysM domain receptor-like kinase 4
Arabidopsis	`AT2G23770` (LYK4) protein kinase family protein / peptidoglycan-binding LysM domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816909] identity=44.1; qcov=0.976; evalue=3.88e-170; confidence=medium
Rice	`Os06g0625200` (OsLysM-RLK6) - identity=38.4; qcov=0.954; evalue=1.87e-108; confidence=medium
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF01476 (LysM); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr); PF23446 (LysM1_NFP_LYK); PF23472 (LysM2_CERK1_LYK3_4_5); PF23473 (LysM3_LYK4_5)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989842

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057769953.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057769953.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769953.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057769953.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057769953.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:44007894`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B94
`Chr6:44007909`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A3,B65,B79,C8,D8
`Chr6:44008182`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr6:44008236`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B133,B134,C69
`Chr6:44008239`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B133,B134,C69
`Chr6:44008246`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B134
`Chr6:44008301`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,B17
`Chr6:44008392`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A15
`Chr6:44008431`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A23,B121,C13,C16,C84
`Chr6:44008588`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B71
`Chr6:44008589`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B123,C37,C41
`Chr6:44008650`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B126,B44,C20,C76

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769953.1

634 aa

317

634

LysM1_NFP_LYK

LysM2_CERK1_LYK3_4_5

LysM

LysM3_LYK4_5

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF23446 LysM1_NFP_LYK 53-109 aa PF23472 LysM2_CERK1_LYK3_4_5 114-167 aa PF01476 LysM 120-165 aa PF23473 LysM3_LYK4_5 182-230 aa PF00069 Pkinase 374-613 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 378-615 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769953.1`	Pfam	`PF23446`	LysM1_NFP_LYK	Domain	53	109	8.2e-24	85.0	NFP/LYK LysM1 domain
`XP_057769953.1`	Pfam	`PF23472`	LysM2_CERK1_LYK3_4_5	Domain	114	167	3.4e-26	91.6	LYK3/4/5 LysM2 domain
`XP_057769953.1`	Pfam	`PF01476`	LysM	Domain	120	165	1.7e-09	38.2	LysM domain
`XP_057769953.1`	Pfam	`PF23473`	LysM3_LYK4_5	Domain	182	230	3e-16	59.9	LYK4/5 LysM3 domain
`XP_057769953.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	374	613	2.1e-38	133.0	Protein kinase domain
`XP_057769953.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	378	615	8.4e-36	124.3	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913970.1
ATGAATTCCCCTTATTTCATCATCTTCCTAATCTCCTGCTTGCCTCTGGTCACGGCGCAGCAGCCATACATCGGCACCCTACTCGAAGACTGCGACAACACAGCCAACAACAACTCCACCTCCGTCCTCGGCTACACCTGCAACGGCCTCCGCCGCAGCTGCCAAGCCTACCTCACCTTCCGCGCGCGGCCCCCCTACGACTCCCCGGCCGGCATCTCCGCCCTCTTATCCGCCAACGCCTCCGAGCTCGCCCGGCTCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989842
ATGAATTCCCCTTATTTCATCATCTTCCTAATCTCCTGCTTGCCTCTGGTCACGGCGCAGCAGCCATACATCGGCACCCTACTCGAAGACTGCGACAACACAGCCAACAACAACTCCACCTCCGTCCTCGGCTACACCTGCAACGGCCTCCGCCGCAGCTGCCAAGCCTACCTCACCTTCCGCGCGCGGCCCCCCTACGACTCCCCGGCCGGCATCTCCGCCCTCTTATCCGCCAACGCCTCCGAGCTCGCCCGGCTCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769953.1
MNSPYFIIFLISCLPLVTAQQPYIGTLLEDCDNTANNNSTSVLGYTCNGLRRSCQAYLTFRARPPYDSPAGISALLSANASELARLNSVSENAALDAERVVLVPVTCSCSGQLYQANASYTVQSGDTYLVIANDTFQGLSTCQALQAQNGIPARELAIGGRLRVPLRCACPTRAQADAGVNYLLSYVLQFNQFVETVTEAFGVDAGATLAANSLSESDTVYPFTTLLVPLRDPPNATQATAPQPPPTPANPTAPPPDSGG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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