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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G003117`

染色体: Chr06 坐标: 44009789-44012028 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G003117`
名称	SmilChr06G003117
描述	UPF0603 protein At1g54780, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	44009789 - 44012028 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989846`
GeneID	`130989846`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989846`
原始查询	`SmilChr06G003117`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	UPF0603 protein At1g54780, chloroplastic
产物	UPF0603 protein At1g54780%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT1G54780` (TLP18.3) thylakoid lumen 18.3 kDa protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841919] identity=70.3; qcov=1.03; evalue=3.33e-135; confidence=high
Rice	`Os05g0401100` - identity=78.1; qcov=0.82; evalue=7.26e-126; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04536 (TPM_phosphatase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989846

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057769957.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	1.00000	`XP_057769957.1`
3	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	1.00000	`XP_057769957.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057769957.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769957.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:44009982`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,C36,C40
`Chr6:44010027`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr6:44010036`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr6:44010120`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,B114,B71,C5,C63
`Chr6:44010288`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:44010363`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:44010447`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,C36,C40
`Chr6:44011583`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B94,C31,C59,D2
`Chr6:44011586`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B94,C31,C59,D2
`Chr6:44011594`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C72
`Chr6:44011709`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769957.1

284 aa

142

284

TPM_phosphatase

PF04536 TPM_phosphatase 99-223 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769957.1`	Pfam	`PF04536`	TPM_phosphatase	Domain	99	223	9.4e-24	84.4	TPM domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913974.1
CCCCCAAATTTCAGACAACCATTCAAAAATAAACACCCAAAAAACATGAACCAATCAAAAATCTCAGAACCCCCAAAACCTCCGAATGATTCAATTCTTCGTCTTCTCTCTCATCAATCCAAATCTCTGAAACTCCCATGGAAACCATACTCTCTCCTCACTCCTTCTGCCCTCTGCTCAAGGCTCGCCCTACCCCCCTGCTCCATCCCAAATCACTCAAACCCATCTGCTGCAATCTCACCAAACACCCCTCTCAATCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989846
ATGGAAACCATACTCTCTCCTCACTCCTTCTGCCCTCTGCTCAAGGCTCGCCCTACCCCCCTGCTCCATCCCAAATCACTCAAACCCATCTGCTGCAATCTCACCAAACACCCCTCTCAATCGATCAAGACCTCGTCTCTCGACAAGCCCGCAGCTTGGATTTCTAACGCGCGCCACGGTTTGGCGGCGCTCGCCATTTCTTTGGCCCTCAATTTCTCCCTGCCGGCTCTAACCGGCGCCGCACTCGCGTCTGAATTCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769957.1
METILSPHSFCPLLKARPTPLLHPKSLKPICCNLTKHPSQSIKTSSLDKPAAWISNARHGLAALAISLALNFSLPALTGAALASEFDVLNDGPPKESYVVDDAGVLSRVTRSDLKRLLTDLESRKGFHINVVTVRKLTSKADAFEYADQVLEKWYPTVEEGNNKGIVVLITSQKEGAVTGGPEFIKAVGDSVLDSIVSENLPILATDEKYNEAVYSSASRLVAAIDGLPDPGGPATKDYKRESNFKTKEETDEKRGQFTL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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