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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G003136`

染色体: Chr06 坐标: 44268928-44271557 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G003136`
名称	SmilChr06G003136
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	44268928 - 44271557 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991015`
GeneID	`130991015`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991015`
原始查询	`SmilChr06G003136`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
产物	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
Arabidopsis	`AT4G38180` (FRS5) FAR1-related sequence 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829974] identity=34; qcov=0.763; evalue=3.56e-113; confidence=low
Rice	`Os02g0542200` - identity=37.1; qcov=0.831; evalue=1.88e-157; confidence=medium
GO	GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00872 (Transposase_mut); PF03101 (FAR1); PF04434 (SWIM); PF10551 (MULE); PF21056 (ZSWIM1-3_RNaseH-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991015

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057771200.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771200.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771200.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057771200.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057771200.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:44269162`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B41
`Chr6:44269162`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B41
`Chr6:44269270`	`TGA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	6	B28,B76,C16,C61,C64,D5
`Chr6:44271364`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771200.1

752 aa

376

752

FAR1

ZSWIM1-3_RNaseH-like

MULE

Transposase_mut

SWIM

PF03101 FAR1 26-111 aa PF21056 ZSWIM1-3_RNaseH-like 204-316 aa PF10551 MULE 234-328 aa PF00872 Transposase_mut 237-417 aa PF04434 SWIM 527-545 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771200.1`	Pfam	`PF03101`	FAR1	Domain	26	111	1.7e-19	71.0	FAR1 DNA-binding domain
`XP_057771200.1`	Pfam	`PF21056`	ZSWIM1-3_RNaseH-like	Domain	204	316	1.3e-10	42.0	Zinc finger SWIM domain-containing protein 1/3, RNaseH-like domain
`XP_057771200.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	234	328	3.1e-26	92.3	MULE transposase domain
`XP_057771200.1`	Pfam	`PF00872`	Transposase_mut	Family	237	417	4.2e-05	23.3	Transposase, Mutator family
`XP_057771200.1`	Pfam	`PF04434`	SWIM	Domain	527	545	0.00076	19.7	SWIM zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915217.1
GTGTTGGATTTACAAGTTTTTTCATTTTTAAATATATCACCTAGATGACAATGGAAGAAGCTCAATGACAAATAATGAAATAACTCACGTGAACTTAAGAGTTTTAAGGCTGCTTTCGTAACTTCTTTTTGTTATTGTGTAATTGCATATTAGTTGATGTAGTTATTAATATTGTGTGTATTTTAATTTTTTTTTTTATGTGACAGACAATTGTTGCACCAATTTTATTAATGGATTTTAGTTCAGATTTAGAGTTGAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991015
ATGGATTTTAGTTCAGATTTAGAGTTGAAGCCTAGAATTGGTATGCAATTTGATAGCTTGGATGAGGTTTGGATGTTTTGGGTGCAATATGGAGGGAAATCAGGATTTGGAGTGAGAAAACATTACAGTAACAAGAACAAGAAAACTGGTCATATAACATCATACAAATATGTTTGTTGTAAGGAGGGTATTCGTAAAGCAGACAAAAGAGATTCTTTGGCACTCAATCCTCGACTTGAAACCCGAACAGATTGTAAAGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771200.1
MDFSSDLELKPRIGMQFDSLDEVWMFWVQYGGKSGFGVRKHYSNKNKKTGHITSYKYVCCKEGIRKADKRDSLALNPRLETRTDCKVRLGVTYMDGKYKINEFIEEHNHPLHLPETVHMLSSQRKITEIQAHEIDLAEDAGLRQKSAYNLLIRRAGGRDGIGYTMLDAKNYLRSKRQRSMVYGEAGCLMRYFQQKLSENPSFYHANQMDMEEQITNVFWADARMLIDYEYFGDVVSLDTTYCTNRANRPLAIFSGFNHHR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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