当前解析结果
SmilChr06G003140| 统一新 Gene ID | SmilChr06G003140 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G003140 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr06G003140 |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 44381890 - 44383784 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130991021 |
|---|---|
| GeneID | 130991021 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130991021 |
| 原始查询 | SmilChr06G003140 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os06g0523701; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os06g0523701; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os06g0523701- identity=32.4; qcov=0.46; evalue=2.46e-39; confidence=low |
| GO | GO:0003676 (nucleic acid binding) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130991021 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057771205.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.20000 | XP_057771205.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057771205.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057771205.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057771205.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr6:44381925 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 4 | B110,B95,C15,C17 |
Chr6:44381925 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B110,B95,C15,C17 |
Chr6:44382002 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B100,B19,C40,C9 |
Chr6:44382044 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B49 |
Chr6:44382079 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A7,B82 |
Chr6:44382133 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C6,C86 |
Chr6:44382206 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B31,C10 |
Chr6:44382226 |
A |
AT |
1bp_insertion | frameshift_variant | 38 | A1,A14,B10,B107,B126,B128,B139,B17,B19,B2,B20,B21,B22,B35,B38,B4,B40,B41,B44,B55,B57,B59,B69,B75,B82,B91,B98,C1,C19,C36,C40,C46,C48,C74,C87,D10,D5,D7 |
Chr6:44382234 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B90,B92 |
Chr6:44382246 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B49 |
Chr6:44382269 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B74 |
Chr6:44382288 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 4 | B102,C18,C59,C72 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。