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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G003148`

染色体: Chr06 坐标: 44502839-44504742 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G003148`
名称	SmilChr06G003148
描述	uncharacterized SmilChr06G003148
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	44502839 - 44504742 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989862`
GeneID	`130989862`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989862`
原始查询	`SmilChr06G003148`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	tetratricopeptide repeat (TPR)-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821034]; symbol=AT3G17670; hit=AT3G17670; species=arabidopsis; confidence=high
产物	tetratricopeptide repeat (TPR)-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821034]; symbol=AT3G17670; hit=AT3G17670; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G17670` (AT3G17670) tetratricopeptide repeat (TPR)-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821034] identity=52.6; qcov=0.824; evalue=7.2e-79; confidence=high
Rice	`Os04g0674100` (OSJNBa0018M05.8) - identity=47; qcov=0.914; evalue=1.17e-67; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF07719 (TPR_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989862

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057769989.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057769989.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057769989.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769989.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057769989.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:44503063`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46
`Chr6:44503188`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46
`Chr6:44503560`	`CTA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B61,C45
`Chr6:44503560`	`CTA`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B61,C45
`Chr6:44504078`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B71
`Chr6:44504078`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B71
`Chr6:44504164`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:44504270`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B46,D1
`Chr6:44504305`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B42,B43,C84,D7
`Chr6:44504395`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B72,B81
`Chr6:44504424`	`ATG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	63	A1,A13,A14,A21,A24,A3,A4,A8,B1,B10,B103,B106,B108,B123,B126,B127,B133,B137,B20,B27,B28,B37,B38,B39,B44,B46,B5,B51,B59,B6,B7,B74,B77,B87,B88,B89,B90,B92,B94,B97,C1,C12,C34,C35,C38,C40,C42,C48,C50,C58,C63,C67,C70,C71,C73,C75,C76,C78,C80,C87,C9,D2,D9
`Chr6:44504427`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	63	A1,A13,A14,A21,A24,A3,A4,A8,B1,B10,B103,B106,B108,B123,B126,B127,B133,B137,B20,B27,B28,B37,B38,B39,B44,B46,B5,B51,B59,B6,B7,B74,B77,B87,B88,B89,B90,B92,B94,B97,C1,C12,C34,C35,C38,C40,C42,C48,C50,C58,C63,C67,C70,C71,C73,C75,C76,C78,C80,C87,C9,D2,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769989.1

256 aa

128

256

TPR_2

PF07719 TPR_2 200-232 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769989.1`	Pfam	`PF07719`	TPR_2	Repeat	200	232	1.3e-11	44.4	Tetratricopeptide repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914006.1
TTTCTATTTTCTGTTATAATTTTGAGATTGAGTTTAGGGGGGGGAAATGATGCTAAACGATATATTGCTATTTTCAGAGGCACTTCTTTTATTCTGAACGACGTCGTCGCCACCTTTACCCCCAAATTAAACCCTAATTAATCCAATTCAATCTCCTTGGAGCTTGAGACAGTTACCTAGACAGGAGCTGGTCACCTCCATGAGAATTGAGTGAAAATGGAAGCTGCTTCCACCTCCCATTTGCTACTCTTTTCCACTAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989862
ATGGAAGCTGCTTCCACCTCCCATTTGCTACTCTTTTCCACTAACCACTTCAGAAAACAAGCCAACCCCTTTACACCAACATCCTCCTCCTCCTCCTCATCATCATCATCTTCAGAAAAGAATGAAAAGATCGAAATTAGAGTGTGCACAAACAGGGCTTGCAGGAAGCAGGGCTCTTTTGATGCCCTGCAAGTTCTCTCCGGCATTGCGCCGCCGTTCGTGACGGTGAACTCATGCGGCTGCCTCGGGCGGTGCGGCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769989.1
MEAASTSHLLLFSTNHFRKQANPFTPTSSSSSSSSSSSEKNEKIEIRVCTNRACRKQGSFDALQVLSGIAPPFVTVNSCGCLGRCGAGPNIVILPGSVFVGHCGTPSKAANVMAVVCGADRDGESKCLEALALRKRAEDEMDRSDFAHACHLLSQAIELTPFGGLHIIYKERSAARLAMGDVDGAFGDVNEALTIAPRYPQAYLCEGDVYMAMDQFDKAEESYSIALDLDPSIRRSKSFKARIAKLQEKLAPANLG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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