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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G003155`

染色体: Chr06 坐标: 44541181-44541970 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G003155`
名称	SmilChr06G003155
描述	uncharacterized SmilChr06G003155
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	44541181 - 44541970 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989868`
GeneID	`130989868`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989868`
原始查询	`SmilChr06G003155`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	homolog of Synechocystis YCF37 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816898]; symbol=YCF37; hit=AT2G23670; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	homolog of Synechocystis YCF37 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816898]; symbol=YCF37; hit=AT2G23670; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT2G23670` (YCF37) homolog of Synechocystis YCF37 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816898] identity=60; qcov=0.828; evalue=3.58e-43; confidence=medium
Rice	`-` -
GO	GO:0009534 (chloroplast thylakoid)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989868

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057770000.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	1.00000	`XP_057770000.1`
3	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	1.00000	`XP_057770000.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057770000.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770000.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:44541475`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A14,B130,B136,B140,C59
`Chr6:44541515`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C51
`Chr6:44541515`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C51
`Chr6:44541516`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	8	A22,A24,B109,B3,B46,C42,C73,D9
`Chr6:44541778`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B34
`Chr6:44541783`	`T`	`TAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	153	A10,A11,A13,A15,A16,A19,A20,A21,A24,A25,A4,A7,A8,A9,B100,B101,B103,B105,B106,B107,B11,B110,B111,B112,B113,B114,B117,B118,B119,B12,B122,B123,B124,B125,B131,B133,B134,B16,B17,B18,B19,B20,B25,B29,B3,B30,B31,B32,B33,B35,B36,B38,B39,B4,B45,B46,B47,B48,B49,B50,B53,B54,B56,B58,B6,B61,B62,B64,B66,B68,B7,B70,B73,B74,B76,B77,B79,B8,B80,B85,B86,B88,B9,B90,B92,B94,B96,B97,B98,C10,C11,C15,C16,C17,C18,C19,C2,C21,C22,C25,C26,C27,C28,C3,C32,C33,C35,C36,C37,C39,C4,C42,C43,C45,C46,C47,C49,C50,C52,C53,C54,C55,C56,C57,C58,C6,C60,C62,C63,C64,C65,C66,C67,C68,C7,C71,C72,C75,C76,C77,C78,C8,C81,C83,C86,C87,D1,D2,D3,D4,D6,D8,D9
`Chr6:44541784`	`GGC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	153	A10,A11,A13,A15,A16,A19,A20,A21,A24,A25,A4,A7,A8,A9,B100,B101,B103,B105,B106,B107,B11,B110,B111,B112,B113,B114,B117,B118,B119,B12,B122,B123,B124,B125,B131,B133,B134,B16,B17,B18,B19,B20,B25,B29,B3,B30,B31,B32,B33,B35,B36,B38,B39,B4,B45,B46,B47,B48,B49,B50,B53,B54,B56,B58,B6,B61,B62,B64,B66,B68,B7,B70,B73,B74,B76,B77,B79,B8,B80,B85,B86,B88,B9,B90,B92,B94,B96,B97,B98,C10,C11,C15,C16,C17,C18,C19,C2,C21,C22,C25,C26,C27,C28,C3,C32,C33,C35,C36,C37,C39,C4,C42,C43,C45,C46,C47,C49,C50,C52,C53,C54,C55,C56,C57,C58,C6,C60,C62,C63,C64,C65,C66,C67,C68,C7,C71,C72,C75,C76,C77,C78,C8,C81,C83,C86,C87,D1,D2,D3,D4,D6,D8,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914017.1
GCCACGTAGGATTATATTTATATTATGAAAGCAAAGTATTGTAGAAAAGCCATATAAGATTATGAATCAAAGAGAAGCAAGTAATCTCTTATAGTATTATATAATGATTCAATCATATATTATATGGAGTTAAATAAAAATATGTTTAGATTTTGGTGGGTAGTGAAGTGGGCTTTTGGTCATTTCCCTCTACAAGCCCGGTGAAGGTAGACCACATAATCACTTGATGAAATTGAATTGAAGTGATGAGATTGTTGATG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989868
ATGGCCTCCACAAACTCCTTCATCGCAGCGCAAATCCTCCCGCCGCACTCCAAGGCCGCGCGCGCGCCGATGCCCACGCGGAGGCAGTGCCTGCTTCTGCTCACCGCGACGACGGCGCTGAGGGCGGCGGAATTGCCGGCCAGAGCGCAGGACATACCGCTGTTCGGGCTGAGGAAGAGCCTCCGCAAGGTGGAGGAAGAGGCGGAGGAGATAGTGAAGGAGGGGTTCGAGGCGGCCGACAAGGGAATCGCGGCGGCCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770000.1
MASTNSFIAAQILPPHSKAARAPMPTRRQCLLLLTATTALRAAELPARAQDIPLFGLRKSLRKVEEEAEEIVKEGFEAADKGIAAAEKGIEVTERGVVAAEKEIETVLAFGGLAQAGVVAGAEVLAVVIASSIVNGILGPEAQKS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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