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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G003160`

染色体: Chr06 坐标: 44562342-44565288 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G003160`
名称	SmilChr06G003160
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	44562342 - 44565288 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991024`
GeneID	`130991024`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991024`
原始查询	`SmilChr06G003160`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
产物	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
Arabidopsis	`AT4G38180` (FRS5) FAR1-related sequence 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829974] identity=30.1; qcov=0.699; evalue=6.64e-91; confidence=low
Rice	`Os06g0166100` - identity=34.9; qcov=0.72; evalue=7.03e-116; confidence=low
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF03101 (FAR1); PF04434 (SWIM); PF10551 (MULE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991024

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057771208.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057771208.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771208.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771208.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057771208.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:44562551`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B55
`Chr6:44562561`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr6:44562578`	`T`	`TTC`	2bp_insertion	frameshift_variant	16	A14,A18,B104,B114,B18,B19,B23,B55,B74,B78,C11,C15,C2,C30,C56,C69
`Chr6:44562583`	`ACT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	27	A14,A18,B1,B104,B110,B114,B122,B13,B140,B18,B19,B23,B55,B74,B77,B78,B84,C11,C15,C2,C30,C39,C44,C56,C64,C69,C86
`Chr6:44562588`	`CGG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	28	A14,A18,B1,B104,B110,B114,B122,B13,B136,B140,B16,B18,B19,B23,B55,B74,B77,B78,B84,C11,C15,C2,C30,C39,C44,C64,C69,C86
`Chr6:44562592`	`T`	`TCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	34	A14,A18,A4,A7,B1,B104,B110,B114,B122,B13,B136,B140,B16,B18,B19,B23,B55,B7,B74,B77,B78,B84,C11,C13,C15,C2,C30,C39,C44,C56,C64,C68,C69,C86
`Chr6:44562601`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	39	A10,A14,A4,A7,B1,B104,B110,B114,B122,B126,B13,B132,B136,B140,B16,B18,B19,B2,B23,B44,B55,B7,B74,B77,B78,B84,C11,C13,C15,C2,C28,C30,C39,C44,C56,C64,C68,C69,C86
`Chr6:44562604`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	42	A10,A14,A4,A7,B1,B104,B110,B114,B122,B126,B13,B132,B136,B140,B16,B18,B19,B2,B23,B24,B44,B55,B7,B74,B77,B78,B83,B84,C11,C13,C15,C2,C28,C30,C39,C44,C64,C68,C69,C86,D2,D7
`Chr6:44562610`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B137,B36,B8
`Chr6:44562631`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	47	A10,A14,A4,A7,A8,B1,B104,B110,B114,B121,B122,B126,B128,B13,B134,B136,B140,B16,B18,B19,B23,B24,B41,B51,B55,B7,B74,B77,B78,C11,C13,C15,C2,C28,C3,C30,C39,C43,C44,C45,C50,C64,C66,C69,C86,D2,D7
`Chr6:44562659`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	16	A7,A8,B104,B124,B49,B55,B77,B79,B83,C14,C2,C39,C4,C59,C60,D7
`Chr6:44562664`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	8	B109,B19,B44,B61,B83,C2,C55,C77

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771208.1

793 aa

396

793

FAR1

MULE

SWIM

PF03101 FAR1 133-222 aa PF10551 MULE 344-438 aa PF04434 SWIM 636-654 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771208.1`	Pfam	`PF03101`	FAR1	Domain	133	222	2.9e-22	79.9	FAR1 DNA-binding domain
`XP_057771208.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	344	438	1e-25	90.6	MULE transposase domain
`XP_057771208.1`	Pfam	`PF04434`	SWIM	Domain	636	654	0.00023	21.3	SWIM zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915225.1
ATGGTGTTTGATTTGAATGTTCCGGATGGAGTTGATGAATTGGAATATTACAATAGTATTGTGAATGATGATGCTATAGATTGGGGCTTGAATAATGTACGAAATGACGAGTTATCGGCATTTGGGTTTCAAATGGAAGAAGACGTGCATGTTGAGGATGTGAATGAAGTGAATGTTGAGGATGTGAATGAAGTGAATGGTGAGGATGTGAATGAAGTGAATGTTGAGGATGTTAATCATGTGAATGTTGAAGACGTTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991024
ATGGTGTTTGATTTGAATGTTCCGGATGGAGTTGATGAATTGGAATATTACAATAGTATTGTGAATGATGATGCTATAGATTGGGGCTTGAATAATGTACGAAATGACGAGTTATCGGCATTTGGGTTTCAAATGGAAGAAGACGTGCATGTTGAGGATGTGAATGAAGTGAATGTTGAGGATGTGAATGAAGTGAATGGTGAGGATGTGAATGAAGTGAATGTTGAGGATGTTAATCATGTGAATGTTGAAGACGTTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771208.1
MVFDLNVPDGVDELEYYNSIVNDDAIDWGLNNVRNDELSAFGFQMEEDVHVEDVNEVNVEDVNEVNGEDVNEVNVEDVNHVNVEDVESEFRHETEDVANEVGHSTAVEFEAVELEAKLAPGCLVDGFDEAFLLYCAYAKQTGFSVRKGNQERFNKTKEVRMKTFVCSCRGLTPTTHIEGRLAVYKKQSSRCNCQALLRIARVEGGPWKVTTFNKDHNHELFPKDQAYLLRSSRHISHTKKSMLEALHSAGIPISRACRFM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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