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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G003167`

染色体: Chr06 坐标: 44618699-44620157 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G003167`
名称	SmilChr06G003167
描述	B3 domain-containing protein Os03g0212300-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	44618699 - 44620157 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989880`
GeneID	`130989880`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989880`
原始查询	`SmilChr06G003167`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	B3 domain-containing protein Os03g0212300-like
产物	B3 domain-containing protein Os03g0212300-like
Arabidopsis	`AT3G18960` (AT3G18960) AP2/B3-like transcriptional factor family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821429] identity=34.5; qcov=0.4; evalue=1.73e-07; confidence=low
Rice	`Os03g0212300` - identity=29.6; qcov=0.467; evalue=1.64e-08; confidence=low
GO	GO:0003677 (DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF02362 (B3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989880

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057770010.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770010.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770010.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057770010.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057770010.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:44618924`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	33	A21,A23,A9,B115,B119,B12,B124,B139,B16,B17,B24,B28,B46,B48,B49,B58,B59,B65,B66,B93,C27,C35,C42,C48,C61,C64,C66,C76,C78,C81,C82,D2,D8
`Chr6:44618932`	`CAG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	33	A21,A23,A9,B115,B119,B12,B124,B139,B16,B17,B24,B28,B46,B48,B49,B58,B59,B65,B66,B93,C27,C35,C42,C48,C61,C64,C66,C76,C78,C81,C82,D2,D8
`Chr6:44619059`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B67,C83
`Chr6:44619073`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B67,C83
`Chr6:44619078`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A1
`Chr6:44619282`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B115
`Chr6:44619291`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B30,C84,C87,D2
`Chr6:44619310`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B69,C38
`Chr6:44619659`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B37,B69,C38
`Chr6:44619718`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr6:44619756`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C56,C65
`Chr6:44619874`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C2,C23,C32,C68

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770010.1

210 aa

105

210

PF02362 B3 13-96 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770010.1`	Pfam	`PF02362`	B3	Domain	13	96	3.4e-18	66.1	B3 DNA binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914027.1
TTAATTTCCACAAGGTGACAAAAACATATAGAATATTAGAGAAGAAGAATCTTCACAGTGCTCACTCTTTCTTAGTTCTGAGCTGCCGAAATCAAATGGCCAAATCCTTCATGATTTTCTGTTACCATGATTTTGAAACAAAACTGAAAATTCCAGCTGCGTTTGTGAAAGATCACGGTTTACATCTTCTTCCTCGACTCTTCCTGCAGCTCAAAACCCAGCCGGCAAGAAGATCTTGGGCCGTCAAGATCAAGAAGATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989880
ATGGCCAAATCCTTCATGATTTTCTGTTACCATGATTTTGAAACAAAACTGAAAATTCCAGCTGCGTTTGTGAAAGATCACGGTTTACATCTTCTTCCTCGACTCTTCCTGCAGCTCAAAACCCAGCCGGCAAGAAGATCTTGGGCCGTCAAGATCAAGAAGATCAACGGCGATTTCTACATCGCCGACGGCTGGTCCCAGTTCGTCAAAGACAACGACATCCTCGAAATGAAACTTCTCATCTTCTACATCGTCGCCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770010.1
MAKSFMIFCYHDFETKLKIPAAFVKDHGLHLLPRLFLQLKTQPARRSWAVKIKKINGDFYIADGWSQFVKDNDILEMKLLIFYIVAASSLRVAIFGHDSCLELPPSSRGVDRPRFDFVLTQARKYRTYLFHEFAEKADLMDKRSVVLQFPPKRRHWPVLVQKNRLRRRCTLELTQGWVGFRVANGLVYGRRYSFEFDSAENVILVKELKN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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