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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G003175`

染色体: Chr06 坐标: 44680280-44682025 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G003175`
名称	SmilChr06G003175
描述	B3 domain-containing protein REM9-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	44680280 - 44682025 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989885`
GeneID	`130989885`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989885`
原始查询	`SmilChr06G003175`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	B3 domain-containing protein REM9-like
产物	B3 domain-containing protein REM9-like
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os03g0212300` - identity=31.7; qcov=0.4; evalue=4.26e-06; confidence=low
GO	GO:0003677 (DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF02362 (B3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989885

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057770017.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770017.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770017.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057770017.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057770017.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:44680556`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B42,B43,C43
`Chr6:44680562`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C59
`Chr6:44680602`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A20,B90,B92,C39,C79
`Chr6:44680682`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B118,B53,D11
`Chr6:44680683`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C11,C69
`Chr6:44680691`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C13,C82
`Chr6:44680704`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,B35,D3
`Chr6:44680728`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A25,B132,B54,B71
`Chr6:44680743`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B93,C23
`Chr6:44680895`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B137
`Chr6:44681510`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	D10,D5
`Chr6:44681539`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B103,B129,B61

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770017.1

241 aa

120

241

PF02362 B3 20-100 aa PF02362 B3 150-234 aa

XP_057770019.1

205 aa

102

205

PF02362 B3 20-79 aa PF02362 B3 114-198 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770017.1`	Pfam	`PF02362`	B3	Domain	20	100	6e-27	94.2	B3 DNA binding domain
`XP_057770017.1`	Pfam	`PF02362`	B3	Domain	150	234	6e-27	94.2	B3 DNA binding domain
`XP_057770019.1`	Pfam	`PF02362`	B3	Domain	20	79	6.4e-20	71.7	B3 DNA binding domain
`XP_057770019.1`	Pfam	`PF02362`	B3	Domain	114	198	6.4e-20	71.7	B3 DNA binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914036.1
TCAAATCGGATAAAATCACATTTTCAACAACATAATAAAATGCTCTATTTATCCCATCGTTTCCATGTTCATCAATAATCATTTCTCACAATGCCGAGATCCCAATATCAACGTGCATCCTTCATGATGTTTTGCCGAGGGGATTTCTCCTCCATGTTGTGTATACCAACAAAGTTCATGACGAAATTCAGACAAGCTGTGCAGCATTCAGTAGTTCTAGAAACTGAATATTCCCCAACACTTTGGGATGTGAAGATCAA...

XM_057914034.1
AAATCGGATAAAATCACATTTTCAACAACATAATAAAATGCTCTATTTATCCCATCGTTTCCATGTTCATCAATAATCATTTCTCACAATGCCGAGATCCCAATATCAACGTGCATCCTTCATGATGTTTTGCCGAGGGGATTTCTCCTCCATGTTGTGTATACCAACAAAGTTCATGACGAAATTCAGACAAGCTGTGCAGCATTCAGTAGTTCTAGAAACTGAATATTCCCCAACACTTTGGGATGTGAAGATCAAAA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130989885
ATGCCGAGATCCCAATATCAACGTGCATCCTTCATGATGTTTTGCCGAGGGGATTTCTCCTCCATGTTGTGTATACCAACAAAGTTCATGACGAAATTCAGACAAGCTGTGCAGCATTCAGTAGTTCTAGAAACTGAATATTCCCCAACACTTTGGGATGTGAAGATCAAAAACTTGAATTCGGATTTTTACATGACAGATGGTTGGTCGGAATTCGTGACAGACAACCAACTTGGTCGCAGAGTTGTTGATGAGGATGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057770017.1
MPRSQYQRASFMMFCRGDFSSMLCIPTKFMTKFRQAVQHSVVLETEYSPTLWDVKIKNLNSDFYMTDGWSEFVTDNQLGERDFLTFRLMSESAFKVSIYRGDDCTKHLTSPMNSRRRVVDEDESGIRRGRRPCKRKGGAQFKEGNPLCFKICLKPYNKTRINLPQKFSKAANMKVKKQVRMEYVGNGRCGVSVAVDARPENYRVDLGKGWPEFRVANGLEPGDSCSFEFNPDEEVIYVKEV

XP_057770019.1
MPRSQYQRASFMMFCRGDFSSMLCIPTKFMTKFRQAVQHSVVLETEYSPTLWDVKIKNLNSDFYMTDGWSEFVTDNQLGRRVVDEDESGIRRGRRPCKRKGGAQFKEGNPLCFKICLKPYNKTRINLPQKFSKAANMKVKKQVRMEYVGNGRCGVSVAVDARPENYRVDLGKGWPEFRVANGLEPGDSCSFEFNPDEEVIYVKEV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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