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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G003179`

染色体: Chr06 坐标: 44719337-44722635 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G003179`
名称	SmilChr06G003179
描述	uncharacterized SmilChr06G003179
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	44719337 - 44722635 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989889`
GeneID	`130989889`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989889`
原始查询	`SmilChr06G003179`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Zinc-finger domain of monoamine-oxidase A repressor R1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816885]; symbol=AT2G23530; hit=AT2G23530; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Zinc-finger domain of monoamine-oxidase A repressor R1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816885]; symbol=AT2G23530; hit=AT2G23530; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G23530` (AT2G23530) Zinc-finger domain of monoamine-oxidase A repressor R1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816885] identity=56.9; qcov=0.634; evalue=1.79e-108; confidence=high
Rice	`Os11g0568300` - identity=59.5; qcov=0.522; evalue=1.86e-93; confidence=medium
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF10497 (zf-4CXXC_R1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989889

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057770026.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770026.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770026.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057770026.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057770026.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:44719506`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B132
`Chr6:44719610`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A19,B45
`Chr6:44719716`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C43,D11
`Chr6:44719804`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108
`Chr6:44719839`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B132,C20,C76
`Chr6:44719931`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B132,C20,C76
`Chr6:44720223`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B30,B88,C38,D11
`Chr6:44720715`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A19,B45
`Chr6:44721544`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A14,A15,B80,C29,C44
`Chr6:44721651`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:44722253`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108
`Chr6:44722264`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B122,B13,B45,B50

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770026.1

454 aa

227

454

zf-4CXXC_R1

PF10497 zf-4CXXC_R1 160-256 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770026.1`	Pfam	`PF10497`	zf-4CXXC_R1	Domain	160	256	1.4e-41	141.3	Zinc-finger domain of monoamine-oxidase A repressor R1

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914043.1
CACAACACACAGTTGTTCTGCACTAAAACCCCGCCTCCAATTTGACCGTTGTAAATCGCTCCTTCTCTCTCCTTGCCTACAAACAGCCACAAAATCTCGAGCTCCACAATCAAACTGTGCAGCTTCAGCAATGGTAGCTCTGACAAGCTCAGCTCCGGAGAACCTCAACATTCCCGAACAGATGCAGCAAGGGGAAGCGCGCGGCGGCGAGATCTCGGATTATGAACTGTGCAGAGAGGAAAGGATCAGAGAGAATCGGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989889
ATGGTAGCTCTGACAAGCTCAGCTCCGGAGAACCTCAACATTCCCGAACAGATGCAGCAAGGGGAAGCGCGCGGCGGCGAGATCTCGGATTATGAACTGTGCAGAGAGGAAAGGATCAGAGAGAATCGGGAGAGAATGCAGAAGCTCGGCATTTTTGATCTCTCTCAGAAATTCAATGCCCCAAAGCCCACTCCCGTCAGAGCCGCTTACCGCAAAGCTCCGCGCCTTCACTCTCCGCTGCCTCCGTCGTCTGCCGGCCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770026.1
MVALTSSAPENLNIPEQMQQGEARGGEISDYELCREERIRENRERMQKLGIFDLSQKFNAPKPTPVRAAYRKAPRLHSPLPPSSAGPTRRSSRLQSSTPVSYCELRVEKKDKSSKEYNILREEGSRPEVYTEEHDKLLGSTEMNWTLFVDGYGKDGKRIYDPVKGKTCHQCRQKTLGQRTHCSNCSMVQGQFCGDCLYMRYGENVLEANANPDWICPVCRGICNCSLCRQAKGWPPTGILYKKISNLGYKSVAHYLIQSR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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