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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G003181`

染色体: Chr06 坐标: 44734177-44735323 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G003181`
名称	SmilChr06G003181
描述	dof zinc finger protein DOF3.4-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	44734177 - 44735323 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989892`
GeneID	`130989892`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989892`
原始查询	`SmilChr06G003181`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	dof zinc finger protein DOF3.4-like
产物	dof zinc finger protein DOF3.4-like
Arabidopsis	`AT3G50410` (OBP1) OBF binding protein 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824205] identity=48.5; qcov=0.996; evalue=6.32e-53; confidence=high
Rice	`Os05g0112200` (OsDof19) - identity=62.5; qcov=0.348; evalue=4.27e-30; confidence=low
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF02701 (Zn_ribbon_Dof)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989892

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057770028.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770028.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770028.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057770028.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057770028.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:44734393`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B111,B117,C21,C27,D2
`Chr6:44734411`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D9
`Chr6:44734497`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B23,C32,C68
`Chr6:44734560`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A4,C23,C79,C82
`Chr6:44734566`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A19
`Chr6:44734575`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A19
`Chr6:44734633`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B62,C49,C54
`Chr6:44734667`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B64,C53,C71
`Chr6:44734707`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B72
`Chr6:44734809`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A25,B132
`Chr6:44734890`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B107,B122,B129,C58,C72
`Chr6:44734992`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C52,C79,D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770028.1

230 aa

115

230

Zn_ribbon_Dof

PF02701 Zn_ribbon_Dof 23-78 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770028.1`	Pfam	`PF02701`	Zn_ribbon_Dof	Family	23	78	1.4e-33	115.5	Dof domain, zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914045.1
CCCATATAGGAGCCGACCCAAACAAAGCCTGTTTCCAGCCGACTCATTTTATGCATTCCTAAAACTAATGCCTCTGCAAAAGCTGCCTCTCTCTCTCATCTCTCTCTCTAACCCCTCTATAATATAAACCCTCTCAGCCCCCAGCATTTGCCAACACTTCTCTTTCTGCACACAGACATAGCATAGATGGCTACGGACACGGCTGAGAGGAAGGCTGCGAGGTCGGGGCAGGCGCCGCCGCCGGAGCCGGAGCACCTCCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989892
ATGGCTACGGACACGGCTGAGAGGAAGGCTGCGAGGTCGGGGCAGGCGCCGCCGCCGGAGCCGGAGCACCTCCCCTGCCCGCGCTGCTCCTCCACCAACACCAAGTTCTGCTACTACAACAACTACAACTTCTCGCAGCCGCGCCACTTCTGCAAGGCCTGCCGCCGCTACTGGACCCACGGCGGCACCCTCCGCGACATCCCCGTCGGCGGCGGCAGCCGCAAGAACGCCAAGCGCTCCCGCTCCTCCGCCGCCGCCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770028.1
MATDTAERKAARSGQAPPPEPEHLPCPRCSSTNTKFCYYNNYNFSQPRHFCKACRRYWTHGGTLRDIPVGGGSRKNAKRSRSSAAAAGGGAFSPPPHHDFRGFPGGASQLLVPFAADHGGAGAFSGDAKMCGSFTSLLNTQGAGLWALGGFGLGLGHGFEEVGFGLGRAVWPFPGVVEGGPASGGGGGGGGASVAGNTWQLESGESGYSNGDCFALPDLAISTPGGNFMK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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