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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G003182`

染色体: Chr06 坐标: 44737399-44741846 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G003182`
名称	SmilChr06G003182
描述	nuclear pore complex protein NUP58
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	44737399 - 44741846 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989893`
GeneID	`130989893`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989893`
原始查询	`SmilChr06G003182`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	nuclear pore complex protein NUP58
产物	nuclear pore complex protein NUP58
Arabidopsis	`AT4G37130` (AT4G37130) hydroxyproline-rich glycoprotein family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829867] identity=62.9; qcov=0.883; evalue=1.39e-172; confidence=high
Rice	`Os09g0453500` - identity=54.7; qcov=0.879; evalue=2.36e-143; confidence=high
GO	GO:0005643 (nuclear pore); GO:0006913 (nucleocytoplasmic transport); GO:0008139 (nuclear localization sequence binding); GO:0017056 (structural constituent of nuclear pore)
KEGG	smil03013 (Nucleocytoplasmic transport - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF28621 (NUP58_M)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989893

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057770029.1`
2	Nuclear pore complex	核孔复合体	1.00000	`XP_057770029.1`
3	Nucleus membrane	核膜	1.00000	`XP_057770029.1`
4	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057770029.1`
5	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057770029.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:44737775`	`A`	`AGC`	2bp_insertion	frameshift_variant	114	A1,A10,A14,A18,A19,A2,A20,A23,A3,A4,A6,A8,B10,B101,B102,B106,B107,B111,B115,B117,B122,B127,B13,B131,B133,B135,B136,B137,B138,B14,B15,B16,B19,B22,B23,B26,B27,B29,B3,B31,B37,B38,B39,B41,B42,B43,B46,B47,B48,B51,B52,B54,B57,B59,B66,B69,B7,B72,B74,B75,B78,B8,B81,B82,B86,B88,B9,B90,B91,B92,B93,B94,B95,B98,C10,C12,C14,C16,C17,C18,C22,C24,C29,C30,C32,C34,C35,C36,C38,C39,C40,C41,C43,C44,C45,C47,C51,C55,C60,C62,C63,C64,C66,C68,C75,C76,C79,C80,C81,C85,C87,D10,D4,D6
`Chr6:44737867`	`CAG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	B112,C26,C37
`Chr6:44737867`	`CAG`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	3	B112,C26,C37
`Chr6:44738202`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A3
`Chr6:44738897`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B60
`Chr6:44738978`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A19,C16,D4
`Chr6:44739052`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr6:44739093`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B62,B7
`Chr6:44739115`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr6:44740174`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B62,B7
`Chr6:44740252`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A21,B123,B26,C78,D6
`Chr6:44740342`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C81

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770029.1

497 aa

248

497

NUP58_M

PF28621 NUP58_M 68-348 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770029.1`	Pfam	`PF28621`	NUP58_M	Family	68	348	7.7e-157	521.6	NUP58 FG repeats

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914046.1
ATTGATTTTCCCTAAAATTTAACCTTCTCCATTTTCTTGCGGTGAATGGCGCCTTTTTCCTTGGTTTAGGGTTTTGATTTTGAAAAAGGAGGAGGAAATGGGTTTTACAGTTCTGTGTCAAACGAACTTCGATTCTGCATCGAGATATTGTTCCGGCGTTCTCCGCCCCAACAAAACACCGTAGAAAAGCTTCAATTGTTGTGAATCATCCCCGAAGATTCCAAGCTTCGCATCGTGAATAGTCCCCGCAATCCTCAAGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989893
ATGGCATTCTCATTCTCCCCTCAGCAGCCGCAGCAATCTCTTTTCCAGTCTCCTTTTCAACAATCCTCGCCGTTCCAACCCCAACAGCAACAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAATCTCCTTTCCAGTTACAATTGTCGCAGCCGCAACAACATCAGCCTCAACCTCAGCCACAGCAGCAGCAGCAGCAGCCGCAGCTCTATCTTTTCACGAATGATAAAGTTCCCGCCACTTATAGTACCAAGTGGGCTGACCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770029.1
MAFSFSPQQPQQSLFQSPFQQSSPFQPQQQQQQQQQQQQQSPFQLQLSQPQQHQPQPQPQQQQQQPQLYLFTNDKVPATYSTKWADLHPDSQKVLLQIEERILEYRDESQRLDQCSRLFDSSVSNNGFELDASYIVQELGGITISMERQKATLQELMTVVKDMLRNTEVAVRSFMILRPRFLHQTKSSAAGASAPSQPSGATVIQTSSGQPAGNSLVQVIDFYSGLPKKPSPFLQQTVARFEKYLLECRQWIEELEQLLL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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