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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G003184`

染色体: Chr06 坐标: 44748109-44750281 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G003184`
名称	SmilChr06G003184
描述	methyl jasmonate esterase 1-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	44748109 - 44750281 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989895`
GeneID	`130989895`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989895`
原始查询	`SmilChr06G003184`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	methyl jasmonate esterase 1-like
产物	methyl jasmonate esterase 1-like
Arabidopsis	`AT2G23610` (MES3) methyl esterase 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816893] identity=48.1; qcov=1; evalue=1.53e-79; confidence=high
Rice	`Os05g0370700` - identity=46.1; qcov=1.03; evalue=5e-76; confidence=high
GO	GO:0009694 (jasmonic acid metabolic process); GO:0009696 (salicylic acid metabolic process); GO:0080030 (methyl indole-3-acetate esterase activity); GO:0080031 (methyl salicylate esterase activity); GO:0080032 (methyl jasmonate esterase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00561 (Abhydrolase_1); PF12146 (Hydrolase_4); PF12697 (Abhydrolase_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989895

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057770037.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057770037.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057770037.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770037.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770037.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:44748274`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr6:44748362`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C37
`Chr6:44748362`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C37
`Chr6:44748376`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:44748570`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A19,A7,B9,C16,D4
`Chr6:44748634`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B123
`Chr6:44749963`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A19,B9,C16,D4
`Chr6:44750074`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,B28,B61,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770037.1

263 aa

132

263

Abhydrolase_1

Hydrolase_4

Abhydrolase_6

PF00561 Abhydrolase_1 9-130 aa PF12146 Hydrolase_4 10-115 aa PF12697 Abhydrolase_6 11-250 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770037.1`	Pfam	`PF00561`	Abhydrolase_1	Domain	9	130	8.5e-17	62.4	alpha/beta hydrolase fold
`XP_057770037.1`	Pfam	`PF12146`	Hydrolase_4	Domain	10	115	7.8e-13	49.0	Serine aminopeptidase, S33
`XP_057770037.1`	Pfam	`PF12697`	Abhydrolase_6	Domain	11	250	3.3e-22	80.9	Alpha/beta hydrolase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914054.1
TGTAACTTAGGATTTTAAAACAGAGATAACATCTAAGACATGGGCCCCCCAGCCTTGTCTTATACCGACTTTGTAATAATCGAGTCATGGGAATGGAAGTGTCAGTCGCGACCAATATTAATACAAACTCTTTAGCTAATGCGATTCCAACTCAATGGAAGAGAGCAGACAGCAGCAGCCGCACTTCGTGGTGGTTCACGGCGCGTGCCACGGCGCGTGGTGCTGGTACAAGGTGGCGACGAAGCTGAGAGCGGAGGGCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989895
ATGGAAGAGAGCAGACAGCAGCAGCCGCACTTCGTGGTGGTTCACGGCGCGTGCCACGGCGCGTGGTGCTGGTACAAGGTGGCGACGAAGCTGAGAGCGGAGGGCCACCGCGTCACCGCCCTCGACATGGCGGCCTCCGGAGCCGATCCGAAGCGCGTGGAGGAGCTGAGCTCCGTCTCCGAATACTGCCGCCCCCTCATAGACTTCATGGCGGCTCTCCCGCCGCAGGAGAGGGTGATTCTGGTGGGCCACAGCATGGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770037.1
MEESRQQQPHFVVVHGACHGAWCWYKVATKLRAEGHRVTALDMAASGADPKRVEELSSVSEYCRPLIDFMAALPPQERVILVGHSMGGVCLSLAMENFPHKISVAVFVTAMMPGPDVSLWALVAEYGKQMDSYIDSQFFFNNGHDKPPTSMVFGPNFLATQLYQHSPPEDLSLATLLMRPMGLFDESGWVKATLSKQNHGSVRRVFVVCEQDLVLKKGFQEWMIENNPVDEVKIISGADHMPMFSKTHELCAHLHDIALK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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