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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G003191`

染色体: Chr06 坐标: 44808402-44812003 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G003191`
名称	SmilChr06G003191
描述	tubby-like F-box protein 5
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	44808402 - 44812003 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989902`
GeneID	`130989902`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989902`
原始查询	`SmilChr06G003191`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	tubby-like F-box protein 5
产物	tubby-like F-box protein 5
Arabidopsis	`AT2G18280` (TLP2) tubby like protein 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816344] identity=62; qcov=1.01; evalue=1.29e-171; confidence=high
Rice	`Os02g0705300` (OsTLP8) - identity=64.3; qcov=1.05; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF01167 (Tub); PF12937 (F-box-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989902

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057770044.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057770044.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057770044.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770044.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770044.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:44809060`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B128,B138,C41,C9
`Chr6:44809150`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	D10,D11
`Chr6:44809171`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,B135,B86,C74
`Chr6:44809180`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr6:44810824`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A16,B105
`Chr6:44811223`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B28,B67,C27,C52,C71

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770044.1

407 aa

204

407

F-box-like

Tub

PF12937 F-box-like 51-94 aa PF01167 Tub 112-402 aa

XP_057770045.1

407 aa

204

407

F-box-like

Tub

PF12937 F-box-like 51-94 aa PF01167 Tub 112-402 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770044.1`	Pfam	`PF12937`	F-box-like	Domain	51	94	7.8e-06	26.3	F-box-like
`XP_057770044.1`	Pfam	`PF01167`	Tub	Domain	112	402	5.3e-102	341.6	Tub family
`XP_057770045.1`	Pfam	`PF12937`	F-box-like	Domain	51	94	7.8e-06	26.3	F-box-like
`XP_057770045.1`	Pfam	`PF01167`	Tub	Domain	112	402	5.3e-102	341.6	Tub family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914061.1
TAATTTAAAGGCGTGGGAAATTAGCAGCCGCGGAGAAGCTCTCTCTTTCCTTTCCTGTACTAAAAAGTCACAGTTATTTTTCTGCGGAAGCTCTCTTTTGGCTCTGCTGGCCGAGGCAAAGTAGCGGCGGCGGTGCAATGTTGACGGCGGCGGTATGAGCAAAATGCCAGTGGTTTCGGTAGCTGATCTGGGGCCCGCATTGCCCATCCACTTCTGATCTGATTCTGTACCTCGATCCCTCAATTTTCAAAGCTTCTCTC...

XM_057914062.1
AAGCTCTCTCTTTCCTTTCCTGTACTAAAAAGTCACAGTTATTTTTCTGCGGAAGCTCTCTTTTGGCTCTGCTGGCCGAGGCAAAGTAGCGGCGGCGGTGCAATGTTGACGGCGGCGGTATGAGCAAAATGCCAGTGGTTTCGGTAGCTGATCTGGGGCCCGCATTGCCCATCCACTTCTGATCTGATTCTGTACCTCGATCCCTCAATTTTCAAAGCTTCTCTCAGGCAGCGTGATCCATTGAAATGTCATTCAAGAGC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130989902
ATGTCATTCAAGAGCATTATAAAGGAGCTGAAAGATGGAATCGGCAGCATGTCTAGGAGAGGTGCTGAGGGGAAGCACTGGCGAAATCGGACCAGATCGTTTGTAGCTCCTGATATGGCTACGCATTCTACACCGAGTGAGCAAGGGCAGTGGGCGAGTTTACCCCCGGAATTGCTGTTGGATATCATCAGGAGAGTCGAAGAGAGCGAGACGGCTTGGCCTGCTAGGACAGTCGTCGTGTTTTGTGCATCAGTCTGTAG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057770044.1
MSFKSIIKELKDGIGSMSRRGAEGKHWRNRTRSFVAPDMATHSTPSEQGQWASLPPELLLDIIRRVEESETAWPARTVVVFCASVCRSWRDVTKEIVKTLEECGRLTFPISLKQPGPRDAPIQCYIKRDRTTSTYRLYFGLTPSENELDKLLLAAKKMRRATSTDFVISFVADDFSRASNTYVGKLRSNFLGTKFTICDGQTPSDGAVRHVTRQSRRFSSNQVSPKLPAYNYSVATLSYELNVLRTRGPRRMNCVMNSIP...

XP_057770045.1
MSFKSIIKELKDGIGSMSRRGAEGKHWRNRTRSFVAPDMATHSTPSEQGQWASLPPELLLDIIRRVEESETAWPARTVVVFCASVCRSWRDVTKEIVKTLEECGRLTFPISLKQPGPRDAPIQCYIKRDRTTSTYRLYFGLTPSENELDKLLLAAKKMRRATSTDFVISFVADDFSRASNTYVGKLRSNFLGTKFTICDGQTPSDGAVRHVTRQSRRFSSNQVSPKLPAYNYSVATLSYELNVLRTRGPRRMNCVMNSIP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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