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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G003204`

染色体: Chr06 坐标: 44876099-44877553 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G003204`
名称	SmilChr06G003204
描述	syntaxin-112-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	44876099 - 44877553 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989926`
GeneID	`130989926`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989926`
原始查询	`SmilChr06G003204`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	syntaxin-112-like
产物	syntaxin-112-like
Arabidopsis	`AT2G18260` (SYP112) syntaxin of plants 112 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816342] identity=52.6; qcov=1.1; evalue=2.59e-98; confidence=high
Rice	`Os03g0736500` (KN) - identity=40.4; qcov=1.04; evalue=3.23e-64; confidence=medium
GO	GO:0000149 (SNARE binding); GO:0005484 (SNAP receptor activity); GO:0005886 (plasma membrane); GO:0006886 (intracellular protein transport); GO:0006887 (exocytosis); GO:0006906 (vesicle fusion); GO:0012505 (endomembrane system); GO:0031201 (SNARE complex); GO:0048278 (GO:0048278)
KEGG	smil04130 (SNARE interactions in vesicular transport - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00804 (Syntaxin); PF05739 (SNARE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989926

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057770085.1`
2	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057770085.1`
3	Vacuole membrane	液泡膜	0.40000	`XP_057770085.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057770085.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770085.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:44876269`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C41
`Chr6:44876269`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C41
`Chr6:44876274`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B91,D9
`Chr6:44876315`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B5
`Chr6:44876374`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B134,C18
`Chr6:44876468`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	17	A3,B10,B16,B21,B44,B67,B75,B77,B9,C22,C33,C35,C59,C64,C69,D5,D9
`Chr6:44876541`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B96
`Chr6:44876630`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B5,C52
`Chr6:44876879`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B43,B52

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770085.1

276 aa

138

276

Syntaxin

SNARE

PF00804 Syntaxin 36-179 aa PF05739 SNARE 185-259 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770085.1`	Pfam	`PF00804`	Syntaxin	Domain	36	179	5.3e-37	127.8	Syntaxin
`XP_057770085.1`	Pfam	`PF05739`	SNARE	Domain	185	259	1.6e-17	63.9	SNARE domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914102.1
GAGACCCAAAAAAAAAAAAGACCTACTAAAAGCCTTGAGATTTTTATTGTTTTTTCTTTATGGAAAATCAAGAAATTAACCAGATACAAATGTTTGGGAACCAACACTACGCAATTAGCAACTGACTCAGAGCGACAATGGCGGGATTTGATAATCCAACGGCTATCACCATCTTCTTCAAATATTTTGATCTCAATCATTTTAATCTTTGTATTAAATCCTCGCAATTTCCTTCTCCATAATTTCCTCTGTTATTCCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989926
ATGAACGATCTCATGACGAAATCGTTTCTAAGTTACGTGGAGTTGAAGAAGCAAGCGCAGAGCGACTTAGAAATGGGGGAAATCAGCCAAAGCGATGAAGAAAATGAAAATCTCACAAACTTCTTCGACCAAGTCGAACACATCAAGAGCGGTATGCAAGAGATCACCCATCTCTTGCTCGATCTTCAAGCTCTCCACGACGAGACCAAATCCACTCATACTGCCAAAATCCTCCGCGGGCTGAGGGATCGGATGGATTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770085.1
MNDLMTKSFLSYVELKKQAQSDLEMGEISQSDEENENLTNFFDQVEHIKSGMQEITHLLLDLQALHDETKSTHTAKILRGLRDRMDSDAAAVLSKTKIVKARLDELDASNEAASGSAVDRMRSSTTSGLRVKLGEIVSGFRALREKIMADYKDGLRRRCYNATGEHPSEEVIEAMVSGKIGEEEAEAEAEAVMDIWRSLNKLHEVFLDMAVLVEGQGHRVDDIERNVAAAASFVGGGTGSLFYAKQMKKGRGKWMCWLWG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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