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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G003207`

染色体: Chr06 坐标: 44889052-44892896 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G003207`
名称	SmilChr06G003207
描述	2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha 2, mitochondrial-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	44889052 - 44892896 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989917`
GeneID	`130989917`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989917`
原始查询	`SmilChr06G003207`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha 2, mitochondrial-like
产物	2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha 2%2C mitochondrial-like
Arabidopsis	`AT5G09300` (AT5G09300) thiamine diphosphate-binding fold (THDP-binding) superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830789] identity=67.1; qcov=0.827; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os12g0183100` - identity=69; qcov=0.823; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005947 (GO:0005947); GO:0009083 (branched-chain amino acid catabolic process); GO:0016624 (oxidoreductase activity, acting on the aldehyde or oxo group of donors, disulfide as acceptor)
KEGG	smil00280 (Valine, leucine and isoleucine degradation - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00640 (Propanoate metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00785 (Lipoic acid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01210 (2-Oxocarboxylic acid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00676 (E1_dh)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989917

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057770068.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	1.00000	`XP_057770068.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057770068.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770068.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770068.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:44892671`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B115,C81
`Chr6:44892676`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C37,C52,D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770068.1

474 aa

237

474

E1_dh

PF00676 E1_dh 137-434 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770068.1`	Pfam	`PF00676`	E1_dh	Domain	137	434	4.4e-92	309.0	Dehydrogenase E1 component

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914085.1
TATTTACATCAATCGCACGTGGCAAGCAAATCCACTCAATTCACTACAATTTACAAATCCAATCTTCTTCGACTGATTGGAGTTTAACTCCAAAATCAAAACTTCTTTGAGCGTATTTATCTATCTCTCTCAGTTCTCGTCTCCGGTGAAACCAATGGCCCTCTACCTATCAAAATCAGGCAAATTTTTGCCCCATTTCATAACAAAAATGTCTTCTTTAGGAATGATCAACCTCAGCTCATTGGGTTCTTGTCTCTCCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989917
ATGGCCCTCTACCTATCAAAATCAGGCAAATTTTTGCCCCATTTCATAACAAAAATGTCTTCTTTAGGAATGATCAACCTCAGCTCATTGGGTTCTTGTCTCTCCCAAAATCCTCCACTTTTAACTGAAGATGGAAGAACCTCATACGCAGCTCCGGGTAACGACCCGACCCATTTCGTATGTCGTCGTTTTGGGTCTGTTAAAGCTGATAAATTGGCTTCTATCAGCACTAATGCCGATTCTCAGCTACTGAATTTCCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770068.1
MALYLSKSGKFLPHFITKMSSLGMINLSSLGSCLSQNPPLLTEDGRTSYAAPGNDPTHFVCRRFGSVKADKLASISTNADSQLLNFPGGVVKFTPELKFLSDAPEERIHCYRVLDESGHLLTSDFVEIDKDIAVRMYKEMVMLQTVDTIFYEAQRQGRISFYVTAMGEEAINIASAAALSMDDFVFPQYREAGVLLWRGFGLQDLANQCFGNIGDNCKGRQMPAHYGSKKHNYFTVASTVATQIPHAVGAAYSLKMEGRD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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