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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G003213`

染色体: Chr06 坐标: 44925439-44927317 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G003213`
名称	SmilChr06G003213
描述	syntaxin-112-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	44925439 - 44927317 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989927`
GeneID	`130989927`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989927`
原始查询	`SmilChr06G003213`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	syntaxin-112-like
产物	syntaxin-112-like
Arabidopsis	`AT2G18260` (SYP112) syntaxin of plants 112 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816342] identity=52.3; qcov=1.11; evalue=4.77e-97; confidence=high
Rice	`Os03g0736500` (KN) - identity=39.7; qcov=1.05; evalue=2.44e-61; confidence=medium
GO	GO:0000149 (SNARE binding); GO:0005484 (SNAP receptor activity); GO:0005886 (plasma membrane); GO:0006886 (intracellular protein transport); GO:0006887 (exocytosis); GO:0006906 (vesicle fusion); GO:0012505 (endomembrane system); GO:0031201 (SNARE complex); GO:0048278 (GO:0048278)
KEGG	smil04130 (SNARE interactions in vesicular transport - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00804 (Syntaxin); PF05739 (SNARE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989927

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057770086.1`
2	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057770086.1`
3	Vacuole membrane	液泡膜	0.20000	`XP_057770086.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057770086.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770086.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:44925574`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B124
`Chr6:44925670`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B135,C84
`Chr6:44925685`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B140,B24,B52
`Chr6:44925703`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B14,B16,B4,B99,C60
`Chr6:44925716`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C81
`Chr6:44925758`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A3,B100,B127,C46
`Chr6:44925810`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A2,B93,C48
`Chr6:44926022`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,B15,C31,C40
`Chr6:44926034`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr6:44926052`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr6:44926072`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B111,B134,B5,C14
`Chr6:44926079`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770086.1

274 aa

137

274

Syntaxin

SNARE

PF00804 Syntaxin 36-179 aa PF05739 SNARE 187-257 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770086.1`	Pfam	`PF00804`	Syntaxin	Domain	36	179	1.7e-35	122.8	Syntaxin
`XP_057770086.1`	Pfam	`PF05739`	SNARE	Domain	187	257	1.6e-16	60.6	SNARE domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914103.1
TTATTTTTTTTCCATATATACTCACTCAGCCACTCTGTTCCACCTATCTTGAGATATTTTCCTTTTCGAACCGTCTCATCTATCTTGAGACATTTCCTTATTTGACCAAAATTTTACTTTTTATTCACTTTTTCATCTACTACACTTTAACATACTAAATACTAATTTCTTAAATCTCGTGCTAAAAGTTGTCTCAAGATAGATGAAACGGATGGAGTATTATTTAGTATTTTGATTATAGTATCTCAAAATTTATTATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989927
ATGAATGATCTCATGACGAAATCGTTTCTAAGTTACGCGGAGTTGAAGAAGCAAGCGCAGAGCGACTTAGAAATGGGGGAAATCAGCCAAAGCGATGAAGAAAATGAAAATCTCACAAACTTCTTCGACCAAGTCGAACGCATCAAGATCGGTATGCAAGAGATCACCCATCTCTTGCTCGATCTTCAAGCTCTCCACGACGAGACAAAATCCACTCATACTGCCAAAATCCTCCGCGGGCTGAGGGATCGGATGGATTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770086.1
MNDLMTKSFLSYAELKKQAQSDLEMGEISQSDEENENLTNFFDQVERIKIGMQEITHLLLDLQALHDETKSTHTAKILRGLRDRMDSDAAAVLGKTKIVKARLDELDASNEAASGSAVDRMRSSTTSGLRVKLGEIVSGFRALREKIIADYKDGLRRRCYNATGEHPSEEVIEAMVSGKIGEEEAEAEAVMDIWRSLNKLHEVFLDMAVLVEGQGHRVDDIERNVAAAASFVGGGTGSLFYAKQMKKGRGKWMCWLWGVG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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