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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G003215`

染色体: Chr06 坐标: 44930822-44937037 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G003215`
名称	SmilChr06G003215
描述	protein MODIFIED TRANSPORT TO THE VACUOLE 1-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	44930822 - 44937037 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989911`
GeneID	`130989911`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989911`
原始查询	`SmilChr06G003215`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein MODIFIED TRANSPORT TO THE VACUOLE 1-like
产物	protein MODIFIED TRANSPORT TO THE VACUOLE 1-like
Arabidopsis	`AT3G16270` (AT3G16270) ENTH/VHS family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820873] identity=49; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0232400` - identity=42.4; qcov=1.03; evalue=8.99e-138; confidence=medium
GO	GO:0032588 (trans-Golgi network membrane); GO:0035091 (phosphatidylinositol binding); GO:0043130 (ubiquitin binding)
KEGG	-
Pfam	PF01417 (ENTH)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989911

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057770052.1`
2	Trans-golgi network	Trans-golgi network	1.00000	`XP_057770052.1`
3	Clathrin-coated vesicle	Clathrin-coated vesicle	0.60000	`XP_057770052.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057770052.1`
5	Endocytic vesicle	Endocytic vesicle	0.40000	`XP_057770055.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:44932191`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B4,B71,C45,C80,D5
`Chr6:44932252`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr6:44932315`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A22,B134
`Chr6:44932512`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C18
`Chr6:44932512`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C18
`Chr6:44932522`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C27
`Chr6:44932608`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	5	A13,B88,B91,C38,C83
`Chr6:44932608`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	5	A13,B88,B91,C38,C83
`Chr6:44932618`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C27
`Chr6:44932659`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C2,C32,C68
`Chr6:44932715`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A13,B42,B91,C83,D5
`Chr6:44932854`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B29

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770052.1

702 aa

351

702

ENTH

PF01417 ENTH 16-129 aa

XP_057770053.1

699 aa

350

699

ENTH

PF01417 ENTH 16-129 aa

XP_057770055.1

691 aa

346

691

ENTH

PF01417 ENTH 16-129 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770052.1`	Pfam	`PF01417`	ENTH	Repeat	16	129	3.4e-08	34.3	ENTH domain
`XP_057770053.1`	Pfam	`PF01417`	ENTH	Repeat	16	129	3.3e-08	34.3	ENTH domain
`XP_057770055.1`	Pfam	`PF01417`	ENTH	Repeat	16	129	3.2e-08	34.3	ENTH domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

5 records

下载 cDNA FASTA

XR_009090785.1
CAATTTTTTTTAAAATTATTATTATTATTAAATTATTATTTTTTTGTACATTTCTCTTACAAAAAAAAAACAAAACAAAAACCCTTGAGAAACATCATCCCTTTCCGATCATTGATTTGTTCAATTTTTTGGTTGGATTCGTTCAATTTTGCGCAGGAAGACCAAATTCCACCCAAATTCGCCTCTTCTACGGTTCCAAGTTTGTCCTTTCAGTTTGAATTGATTAATTATTGAATTAATTTGATCAGTAATTGGAGCGG...

XM_057914070.1
CAATTTTTTTTAAAATTATTATTATTATTAAATTATTATTTTTTTGTACATTTCTCTTACAAAAAAAAAACAAAACAAAAACCCTTGAGAAACATCATCCCTTTCCGATCATTGATTTGTTCAATTTTTTGGTTGGATTCGTTCAATTTTGCGCAGGAAGACCAAATTCCACCCAAATTCGCCTCTTCTACGGTTCCAAGTTTGTCCTTTCAGTTTGAATTGATTAATTATTGAATTAATTTGATCAGTAATTGGAGCGG...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA

LOC130989911
ATGGAGCAGAGCAGGAGAGCGGTAGAGTCGTATTGGAGGTCAAGAATGGTGGACGGCGCCACGTCCGATGAGGATAAGGTGACTCCGGTTTACAAATTGGAAGAAATTTGCGATTTGCTGAGGTCGTCGCACCCCTCCATCGTTAAGGAAGTCTCCGAGTTTATTCTCAAGCGTCTCGACCACAAATCGTCTATTGTTAAGCAGAAGGCCTTAAGAGTCATCAAATATGCAGTGGGAAAGTCAGGTGCTGAGTTCAGAAG...

LOC130989911
ATGCAAAGGAATTCTGTTGCCGTACGCCAATTAATCCACTACAGGGGCCAGCCAGATCCTTTGAAGGGCGATGCACTGAACAAGGCTGTCCGTGAAACAGCACAGGAAACACTCTCTGTTTTATTCACATCGGATGAGAGCAAAGCTGCACCTAAAGAAAGTAAACTTGGTAGTCGAATTCAAGGATTTGGGAATACTAACTATGAATTGCCTTCAGAAGATAAAAGGTCCTTCATTAATGAGATTGTTGACATTGGAAG...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA

XP_057770052.1
MEQSRRAVESYWRSRMVDGATSDEDKVTPVYKLEEICDLLRSSHPSIVKEVSEFILKRLDHKSSIVKQKALRVIKYAVGKSGAEFRREMQRNSVAVRQLIHYRGQPDPLKGDALNKAVRETAQETLSVLFTSDESKAAPKESKLGSRIQGFGNTNYELPSEDKRSFINEIVDIGSATIKQGLSSLAQSPSLRKNNDTGSYRSPNLQRSLAPERDHSERYEAVDYNTDMQSSSRFSKNAGSGSWGQDLSASQAETSDGVYE...

XP_057770053.1
MEQSRRAVESYWRSRMVDGATSDEDKVTPVYKLEEICDLLRSSHPSIVKEVSEFILKRLDHKSSIVKQKALRVIKYAVGKSGAEFRREMQRNSVAVRQLIHYRGQPDPLKGDALNKAVRETAQETLSVLFTSDESKAAPKESKLGSRIQGFGNTNYELPSEDKRSFINEIVDIGSATIKQGLSSLAQSPSLRKNNDTGSYRSPNLQRSLAPERDHSERYEAVDYNTDMQSSSRFSKNAGSGSWGQDLSASQAETSDGVYE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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