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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G003218`

染色体: Chr06 坐标: 44950029-44952565 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G003218`
名称	SmilChr06G003218
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	44950029 - 44952565 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990019`
GeneID	`130990019`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990019`
原始查询	`SmilChr06G003218`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
产物	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
Arabidopsis	`AT4G38180` (FRS5) FAR1-related sequence 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829974] identity=30.2; qcov=0.715; evalue=1.92e-85; confidence=low
Rice	`Os06g0166100` - identity=33.5; qcov=0.743; evalue=1.99e-112; confidence=low
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF03101 (FAR1); PF10551 (MULE); PF21056 (ZSWIM1-3_RNaseH-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990019

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057770205.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770205.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770205.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057770205.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057770205.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:44950152`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B69,B93,C21,C26,C53
`Chr6:44950213`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B69,C21,C53
`Chr6:44950291`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C32,C80
`Chr6:44950301`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B113
`Chr6:44950352`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr6:44950380`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B3,C63
`Chr6:44950390`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C26,C49
`Chr6:44950422`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	B115,B43,B50,B76,C55,C9
`Chr6:44950434`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	20	A2,B10,B107,B11,B115,B131,B138,B20,B24,B60,B65,C11,C37,C46,C53,C69,C7,D11,D5,D6
`Chr6:44950454`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C20
`Chr6:44950456`	`A`	`AGG`	2bp_insertion	frameshift_variant	4	A14,A23,B103,B64
`Chr6:44950456`	`A`	`AGG`	2bp_insertion	CDS_variant	4	A14,A23,B103,B64

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770205.1

787 aa

394

787

FAR1

ZSWIM1-3_RNaseH-like

MULE

PF03101 FAR1 82-171 aa PF21056 ZSWIM1-3_RNaseH-like 270-377 aa PF10551 MULE 295-389 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770205.1`	Pfam	`PF03101`	FAR1	Domain	82	171	6.9e-18	65.9	FAR1 DNA-binding domain
`XP_057770205.1`	Pfam	`PF21056`	ZSWIM1-3_RNaseH-like	Domain	270	377	3.8e-07	30.8	Zinc finger SWIM domain-containing protein 1/3, RNaseH-like domain
`XP_057770205.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	295	389	5.3e-29	101.2	MULE transposase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914222.1
ATGGAGTCGTTTGACGCTAGCGAATCCGAAGGTGAGACTGATGACATGAATTACAGCAATCCAACTATCGATACTCATGTTGCTGATGATGACTGTGAGGAAGATGGTAGTACTGAGATTGGCGGCAAGAGTACTGATTGTGATACGAATGTTGATGTTGATTCACTCGAAGCATTGAAAAGAAGATATGAAAGCAGTCTTGCTGTAGGTTCTACTATAGACACTTTACATGAGGTGCACGAATTATACTGTGATTATGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990019
ATGGAGTCGTTTGACGCTAGCGAATCCGAAGGTGAGACTGATGACATGAATTACAGCAATCCAACTATCGATACTCATGTTGCTGATGATGACTGTGAGGAAGATGGTAGTACTGAGATTGGCGGCAAGAGTACTGATTGTGATACGAATGTTGATGTTGATTCACTCGAAGCATTGAAAAGAAGATATGAAAGCAGTCTTGCTGTAGGTTCTACTATAGACACTTTACATGAGGTGCACGAATTATACTGTGATTATGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770205.1
MESFDASESEGETDDMNYSNPTIDTHVADDDCEEDGSTEIGGKSTDCDTNVDVDSLEALKRRYESSLAVGSTIDTLHEVHELYCDYASVMGFSVRKGRQGYIKPTRDVRMKMYHCSCEGATDNKASVGRVAAFKKQSYRSHCKAMLRVVRADIESPWRVTSFVKQHSHELVNPRESYLLRSARNMSRQKKSLVISMRASGIGVSRAYRFLEKEAGSRENIGFIRKDIYNELQKESRKVSKINDGDANKLLEMLTDRGMSD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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