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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G003223`

染色体: Chr06 坐标: 44994120-44997016 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G003223`
名称	SmilChr06G003223
描述	SWR1 complex subunit 6
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	44994120 - 44997016 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989934`
GeneID	`130989934`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989934`
原始查询	`SmilChr06G003223`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	SWR1 complex subunit 6
产物	SWR1 complex subunit 6
Arabidopsis	`AT5G37055` (SEF) HIT-type Zinc finger family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833676] identity=72.4; qcov=1.01; evalue=5.16e-88; confidence=high
Rice	`Os03g0367800` - identity=67; qcov=1.01; evalue=7.1e-81; confidence=high
GO	GO:0000812 (Swr1 complex); GO:0006338 (chromatin remodeling); GO:0031491 (nucleosome binding)
KEGG	smil03082 (ATP-dependent chromatin remodeling - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF04438 (zf-HIT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989934

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057770090.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770090.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770090.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057770090.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057770090.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:44994414`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C61
`Chr6:44994474`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770090.1

172 aa

172

zf-HIT

PF04438 zf-HIT 131-159 aa

XP_057770091.1

172 aa

172

zf-HIT

PF04438 zf-HIT 131-159 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770090.1`	Pfam	`PF04438`	zf-HIT	Domain	131	159	8.7e-10	38.9	HIT zinc finger
`XP_057770091.1`	Pfam	`PF04438`	zf-HIT	Domain	131	159	8.7e-10	38.9	HIT zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914107.1
TTGAAAAAAATTGGAATGACAAAATTACAAAAATTAAAAAAATGATAATTTAATTCGTCACATCTCAAAAATCACATTAAAATTGAGGATTCAAAATTATTTGTAATTTTATTTACAAAACCCCGTTCAAAGAAAATGAGAACTCATACATTGAGCAGTGTAGGGACAGTTCTCGCATTTCCCAAGTGGTAGCCAAACAAAGCGCAGTTGAAACTCATCCTCTGCCTCGACCGCGATCATCCACTACTCTCCATCTCCAT...

XM_057914108.1
TTGAAAAAAATTGGAATGACAAAATTACAAAAATTAAAAAAATGATAATTTAATTCGTCACATCTCAAAAATCACATTAAAATTGAGGATTCAAAATTATTTGTAATTTTATTTACAAAACCCCGTTCAAAGAAAATGAGAACTCATACATTGAGCAGTGTAGGGACAGTTCTCGCATTTCCCAAGTGGTAGCCAAACAAAGCGCAGTTGAAACTCATCCTCTGCCTCGACCGCGATCATCCACTACTCTCCATCTCCAT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130989934
ATGGAAGAAGACATGTCCAGTTCGCTGAGGCGGATGTCTATGAGAACTCGTAAGGTTGCTCCGAAAATGGCTGCAGCCCTTGCCAGCAGTGACAATCGGACTCAGGCAATGCTGGCACGTCTTGAAGCTCTGGAAAATGATAATGCTGGATTCGAGACCGTGCAAGTTGATGATGATGACGAAGCCTCCCTTGATGATGATGATCAAGCATATCAGAAGAAGCAGTCCAGAAGCACAAAGCGCAAAACGCGTCAAGCCAA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057770090.1
MEEDMSSSLRRMSMRTRKVAPKMAAALASSDNRTQAMLARLEALENDNAGFETVQVDDDDEASLDDDDQAYQKKQSRSTKRKTRQAKALENAKKAPRTFLELLQEANLESLPPHVPSYLRAAVGPPSSTARRHFCTVCGFSANYTCLQCGMRFCTIRCQNIHNDTRCLKFVA

XP_057770091.1
MEEDMSSSLRRMSMRTRKVAPKMAAALASSDNRTQAMLARLEALENDNAGFETVQVDDDDEASLDDDDQAYQKKQSRSTKRKTRQAKALENAKKAPRTFLELLQEANLESLPPHVPSYLRAAVGPPSSTARRHFCTVCGFSANYTCLQCGMRFCTIRCQNIHNDTRCLKFVA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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