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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G003224`

染色体: Chr06 坐标: 44997374-44998927 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G003224`
名称	SmilChr06G003224
描述	uncharacterized SmilChr06G003224
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	44997374 - 44998927 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989935`
GeneID	`130989935`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989935`
原始查询	`SmilChr06G003224`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	polyadenylate-binding protein 1-B-binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827739]; symbol=AT4G19950; hit=AT4G19950; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	polyadenylate-binding protein 1-B-binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827739]; symbol=AT4G19950; hit=AT4G19950; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT4G19950` (AT4G19950) polyadenylate-binding protein 1-B-binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827739] identity=42.3; qcov=1.01; evalue=9.06e-67; confidence=medium
Rice	`Os08g0107100` - identity=43; qcov=1.01; evalue=4.81e-65; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF29520 (DUF8558)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989935

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057770092.1`
2	Vacuole	液泡	0.60000	`XP_057770092.1`
3	Vacuole membrane	液泡膜	0.60000	`XP_057770092.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057770092.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770092.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:44997735`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr6:44997737`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	47	A1,A14,A15,A16,A23,A25,A5,A6,B102,B105,B106,B11,B110,B113,B118,B127,B134,B138,B14,B23,B31,B41,B49,B58,B60,B62,B68,B73,B84,B86,B89,C12,C13,C26,C3,C36,C43,C45,C47,C49,C5,C62,C7,C70,C71,C79,C83
`Chr6:44997744`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B114,B16
`Chr6:44997798`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	14	A5,A7,B115,B124,B134,B20,B65,B68,B78,C18,C37,C54,C75,C8
`Chr6:44997939`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B95
`Chr6:44997944`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,B112,B12,C73
`Chr6:44997947`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B95
`Chr6:44997976`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B28
`Chr6:44997976`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B28
`Chr6:44997986`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A16,C50,C7
`Chr6:44998001`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C57
`Chr6:44998049`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A4,C13,C81,C86

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770092.1

332 aa

166

332

DUF8558

PF29520 DUF8558 1-330 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770092.1`	Pfam	`PF29520`	DUF8558	Domain	1	330	1.9e-146	488.3	Domain of unknown function (DUF8558)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914109.1
TTTTATTTATAACTTTAATTCACCATTAATAAGTTTTATAATAAAATACAATTAATTCACAATTAGAAATTTTTGTGATTATGGTCAATTCATTATTAATGAACGTTATAATAATATTAATAAAAATAAAATCAAATGCGTGGCTAAGCCCCAAAAATTAGAAAACCGTGTTCCAAATTTGACCAACGGCACCGACCCAAACAACACTATCCAATAAGTCAATATCCCTTCCCTTCTTCCAGCCATCATTTCCAAGATTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989935
ATGGACAGGGAGCAGGAAGAAATCCAATTCCTAGGGTTCTTCGGAATCCTGCAGGAATCGTGCAACATAGTGGCGTCGTGGAAGAAGATCTTCGCCCAAATCACGGTAGCCCTAATCATCCCCCTCTCCTTCATCTACCTCGCGCACATCGAGATCTCGGAGCTCCTCTTCACCAAGATCATGCACAACGAATTCATCCTCGACCAGACCCCGGAGGGCACCGGCGCCTACGACCGCCTCAGCGCCCTCCTCTCCTCCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770092.1
MDREQEEIQFLGFFGILQESCNIVASWKKIFAQITVALIIPLSFIYLAHIEISELLFTKIMHNEFILDQTPEGTGAYDRLSALLSSELTTFFLFKIGYFIFFIVLALLSTSAVVYTVACIYTARDLSLRTIVSVVPIVWRRLIVTFIWNFVIVFAYNVASLVVLVVGAVVLGQIPILGPAFLIAGAAAYLVGFLYITIIWHVATVVSVLEESYGLNAMTKSQDLIKGKMGVAFAVFMVIGVCFFAIQLMFEVLVVQGDGG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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