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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G003231`

染色体: Chr06 坐标: 45031515-45038362 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G003231`
名称	SmilChr06G003231
描述	mitogen-activated protein kinase kinase kinase 3
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	45031515 - 45038362 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989943`
GeneID	`130989943`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989943`
原始查询	`SmilChr06G003231`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	mitogen-activated protein kinase kinase kinase 3
产物	mitogen-activated protein kinase kinase kinase 3
Arabidopsis	`AT1G53570` (MAP3KA) mitogen-activated protein kinase kinase kinase 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841792] identity=57.1; qcov=1.03; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os11g0207200` (OsMAPKKKalpha) - identity=61.8; qcov=0.676; evalue=5.92e-173; confidence=high
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989943

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057770103.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057770103.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057770103.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057770103.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770103.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:45031872`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B65,B90,B92,C25
`Chr6:45032801`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B96
`Chr6:45032801`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B96
`Chr6:45032824`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B121,B135
`Chr6:45033199`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B24,D10
`Chr6:45036151`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B51,C41
`Chr6:45036756`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B23
`Chr6:45037605`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B55,B66,C13,C2,C68
`Chr6:45037662`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr6:45037665`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B46,C85

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770103.1

620 aa

310

620

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF00069 Pkinase 225-480 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 227-475 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770103.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	225	480	6e-74	249.5	Protein kinase domain
`XP_057770103.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	227	475	7.3e-47	160.6	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914120.1
GGCTTAGCTGTTTATCATTTTGTTTCCGTTTTCTCTCTCTTGAGCCGACGGCCCCCCACTCTCTCTCTCTAAAATAATTCAAACAAAATTAGCCATAACAGAGCTAAAGACAAACCACGAATACTCCAAATTCTCATATACATACATGTGTGGATACGTATACGCGGAATAGGGTCTTTTCTTCTTCAACTCTCATCGAACTTATTCCCAATATAAATTCAACCAATTTCCAATCTGTCTCTCCATTTCTCTCTCTCTCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989943
ATGCCGGCTTGGTGGAGTAAGAAGTCTGGGCGGAGCAAAGATTCGGAAAATTCGGCGAAGAGCGCATCCCTGAAGAATGAGAAGAAGAGAGGGAAAGAGATTGACCACAAAGTCAAAAGCTTGGACGAAGGTCTACTGCAGCAGCAGTCGAGAAATTCGCCGAGAGTTAGCAGAGAATTTTTCCCCGGGGTAAGAGAATTGAGCGGCGGAGATTCATCGGGCTTCTCCGGGTTCGATTCGGCGTCTTCGTTGGATAAAGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770103.1
MPAWWSKKSGRSKDSENSAKSASLKNEKKRGKEIDHKVKSLDEGLLQQQSRNSPRVSREFFPGVRELSGGDSSGFSGFDSASSLDKGQPQPLPRPLGASNDPVHGVGSGSGSGSVSSVSSSGSSDDHAHVAADQAAFRGHGGGRLSPLLRSPGRGSRCNTTPVSPLHARFSGMSLDSPGGKLEEGKSEFHKLPLPPGSPANSSALPTPRSPGTNESSSCNSSKWRKGKLLGRGTFGHVYLGFNSENGQMCAIKEVRLVSD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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