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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G003238`

染色体: Chr06 坐标: 45081906-45088176 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G003238`
名称	SmilChr06G003238
描述	NAC domain-containing protein 82-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	45081906 - 45088176 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989950`
GeneID	`130989950`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989950`
原始查询	`SmilChr06G003238`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	NAC domain-containing protein 82-like
产物	NAC domain-containing protein 82-like
Arabidopsis	`AT5G09330` (NAC082) NAC domain containing protein 82 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830792] identity=42.3; qcov=0.868; evalue=6.91e-88; confidence=medium
Rice	`Os05g0426200` (ONAC036) - identity=67.4; qcov=0.385; evalue=1.27e-84; confidence=low
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF02365 (NAM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989950

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057770112.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770112.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770112.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057770112.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057770112.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:45082619`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	16	A15,B119,B125,B38,B39,B55,B68,B9,B95,C14,C2,C22,C32,C68,C76,C84
`Chr6:45082624`	`ACG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B51,C41
`Chr6:45082624`	`ACG`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B51,C41
`Chr6:45082667`	`GAT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	60	A10,A11,A9,B10,B101,B104,B107,B11,B117,B129,B138,B14,B15,B20,B22,B3,B32,B40,B5,B54,B6,B66,B67,B71,B72,B74,B78,B79,B81,B82,B87,B88,B90,B92,B97,B98,C1,C11,C12,C28,C31,C34,C36,C4,C46,C5,C52,C53,C58,C60,C64,C66,C67,C69,C7,C70,C72,C73,D10,D11
`Chr6:45082823`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C25
`Chr6:45082839`	`A`	`ACC`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	B125,C18,C87
`Chr6:45082839`	`A`	`ACC`	2bp_insertion	CDS_variant	3	B125,C18,C87
`Chr6:45083546`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr6:45083840`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr6:45083939`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B139
`Chr6:45083970`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C24
`Chr6:45085064`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,B117,C51

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770112.1

572 aa

286

572

NAM

PF02365 NAM 4-130 aa

XP_057770113.1

455 aa

228

455

NAM

PF02365 NAM 4-130 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770112.1`	Pfam	`PF02365`	NAM	Family	4	130	5.2e-43	147.1	No apical meristem (NAM) protein
`XP_057770113.1`	Pfam	`PF02365`	NAM	Family	4	130	3.5e-43	147.7	No apical meristem (NAM) protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914129.1
GTAAATCAACCAATGAGAAGATTAGCTTACTCCACAAGCTTGACACTATTGCACTCTCTCGCTCTAAACCCTTCTCTTTACTTCTATATAAACCCTCCCCCATCCACAATTTCTCCCTCTCTCGTTATTTTTTCTTGAGCTTTTCTTGTATTTCTTGTACGCGTTTTCCCTCTACGTTCCACCGGGTTGTCTCCCTTCGAGGGCTTGTATTGCACACCAGATGTCTTTTGATTCCAACAAGAAGCATCAGTGGTTTGTGT...

XM_057914130.1
GTAAATCAACCAATGAGAAGATTAGCTTACTCCACAAGCTTGACACTATTGCACTCTCTCGCTCTAAACCCTTCTCTTTACTTCTATATAAACCCTCCCCCATCCACAATTTCTCCCTCTCTCGTTATTTTTTCTTGAGCTTTTCTTGTATTTCTTGTACGCGTTTTCCCTCTACGTTCCACCGGGTTGTCTCCCTTCGAGGGCTTGTATTGCACACCAGATGTCTTTTGATTCCAACAAGAAGCATCAGTGGTTTGTGT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130989950
ATGCGTCTCCCCCCAGGATTCCGCTTTCATCCTACAGATGTTGAGTTGGTTTTGTACTATCTCAAGAGGAAGATTTTGGGTAAGAAGCTTCTCTATGAGGCTATTGCAGAAGTCAACATCTACAAATACTCTCCATGGGATCTTCCAGATAAATCCAGCTTGAAAAGTAAGGATCTGGAGTGGTTCTTTTTCTGTCCAAGAGAGAAGAAGTATGCATGTGGAGTCCGTGTCAAGCGTGCAACTGAAAATGGATATTGGAA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057770112.1
MRLPPGFRFHPTDVELVLYYLKRKILGKKLLYEAIAEVNIYKYSPWDLPDKSSLKSKDLEWFFFCPREKKYACGVRVKRATENGYWKTTGKDRTISCNEKTVGAVKTLIFHLGHAPKGERTDWVIHEYRVVDNQLAEAGVQDNYVLCKVFKKNGLGPKNGAQYGAPFNEADWTDDDDNVAENHAISLAAEGLPQTSGMQNEEQSLPLGSGLFDSGNGPLPILEDGPSSSAVAPNSMVAADKTNDEIVHMLASFADEDMLL...

XP_057770113.1
MRLPPGFRFHPTDVELVLYYLKRKILGKKLLYEAIAEVNIYKYSPWDLPDKSSLKSKDLEWFFFCPREKKYACGVRVKRATENGYWKTTGKDRTISCNEKTVGAVKTLIFHLGHAPKGERTDWVIHEYRVVDNQLAEAGVQDNYVLCKVFKKNGLGPKNGAQYGAPFNEADWTDDDDNVAENHAISLAAEGLPQTSGMQNEEQSLPLGSGLFDSGNGPLPILEDGPSSSAVAPNSMVAADKTNDEIVHMLASFADEDMLL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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