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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G003245`

染色体: Chr06 坐标: 45143007-45148113 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G003245`
名称	SmilChr06G003245
描述	autophagy-related protein 101
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	45143007 - 45148113 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989957`
GeneID	`130989957`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989957`
原始查询	`SmilChr06G003245`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	autophagy-related protein 101
产物	autophagy-related protein 101
Arabidopsis	`AT5G66930` (AT5G66930) meiotically up-regulated protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836827] identity=74.7; qcov=1.01; evalue=2.34e-117; confidence=high
Rice	`Os12g0428200` (OsGH9B17) - identity=59.4; qcov=1.02; evalue=1.97e-88; confidence=high
GO	GO:0000045 (autophagosome assembly); GO:0000407 (phagophore assembly site); GO:0006914 (autophagy)
KEGG	smil04136 (Autophagy - other - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF07855 (ATG101)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989957

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057770119.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057770119.1`
3	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.60000	`XP_057770119.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057770119.1`
5	Vesicle	囊泡	0.60000	`XP_057770119.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:45144219`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97
`Chr6:45144228`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A3,B102,B122,B13,B79
`Chr6:45145450`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108
`Chr6:45147755`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A23,C11,C40,C69
`Chr6:45147764`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770119.1

215 aa

108

215

ATG101

PF07855 ATG101 10-177 aa

XP_057770120.1

215 aa

108

215

ATG101

PF07855 ATG101 10-177 aa

XP_057770121.1

215 aa

108

215

ATG101

PF07855 ATG101 10-177 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770119.1`	Pfam	`PF07855`	ATG101	Family	10	177	1.9e-55	187.7	Autophagy-related protein 101
`XP_057770120.1`	Pfam	`PF07855`	ATG101	Family	10	177	1.9e-55	187.7	Autophagy-related protein 101
`XP_057770121.1`	Pfam	`PF07855`	ATG101	Family	10	177	1.9e-55	187.7	Autophagy-related protein 101

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914138.1
GAAATTTCCAGCTCTAATATTTTTGCATAATTCTTCCTCTCTTTGCTTTATCAGTGCTAAAAAACCCTTCAATTCCGCCAATTCATCTTCCTCATCTGTTTTTGAATGCTCCAAATAGTTATAGAAGCTGCATTTTCTGGATTCTGCTGATTTCTGCTTGAGAGATTTTTTTTTGCTGAAGTTATAGATGGTTTAAAAGGCGCAAAAACTGTAGTTACAAAATTACAAATAATCCTCACGGTCGGTGTGTTTGAATATGT...

XM_057914136.1
TTTTGCATAATTCTTCCTCTCTTTGCTTTATCAGTGCTAAAAAACCCTTCAATTCCGCCAATTCATCTTCCTCATCTGTTTTTGAATGCTCCAAATAGTTATAGAAGCTGCATTTTCTGGATTCTGCTGATTTCTGCTTGAGAGATTTTTTTTTGCTGAAGTTATAGATGGTTTAAAAGGCGCAAAAACTGTAGTTACAAAATTACAAATAATCCTCACGTCTCTTTCATCGCAGAGGATGTGTATATTTGACGACTTCG...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC130989957
ATGAGCTGCGAAGTCTGCCAACTCAAAGAACTCGATGTTGAGCACTTCGAGATACGCGAAGTTCTTCGATGCATTCTGCACACTATTTTGTTCCACAGAGCTTTAGGGCTTGTGCGCCCGAAAGACATTGATTTGGAACTTTTCGAGATTACATATGTGCAATGTGGTGATGTAGAACTTGAGAGGAAAATAGATGAGAAGATTGACCAATTCATAGACAGGGTGGAGAAGCACCCGAATAAGAAAAATCAGATATGTTT...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057770119.1
MSCEVCQLKELDVEHFEIREVLRCILHTILFHRALGLVRPKDIDLELFEITYVQCGDVELERKIDEKIDQFIDRVEKHPNKKNQICLSFYEVKNKQPTWFTNKVERLYWEQWYINLNVAQHQKGHSGKSTSSKIVVDPGAEERTVRRAALEASLRDVLFQIIKFVNEKKDHIPPIPNLEGVSFPYEITISSSSDSAFGMEMFKRMLQTGQPTMLS

XP_057770120.1
MSCEVCQLKELDVEHFEIREVLRCILHTILFHRALGLVRPKDIDLELFEITYVQCGDVELERKIDEKIDQFIDRVEKHPNKKNQICLSFYEVKNKQPTWFTNKVERLYWEQWYINLNVAQHQKGHSGKSTSSKIVVDPGAEERTVRRAALEASLRDVLFQIIKFVNEKKDHIPPIPNLEGVSFPYEITISSSSDSAFGMEMFKRMLQTGQPTMLS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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