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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G003252`

染色体: Chr06 坐标: 45187905-45193350 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G003252`
名称	SmilChr06G003252
描述	ferrochelatase-2, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	45187905 - 45193350 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989962`
GeneID	`130989962`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989962`
原始查询	`SmilChr06G003252`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ferrochelatase-2, chloroplastic
产物	ferrochelatase-2%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT2G30390` (FC2) ferrochelatase 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817589] identity=79.8; qcov=0.949; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0361200` (FC2) - identity=85.5; qcov=0.915; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004325 (protoporphyrin ferrochelatase activity); GO:0006783 (heme biosynthetic process)
KEGG	smil00860 (Porphyrin metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01240 (Biosynthesis of cofactors - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00762 (Ferrochelatase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989962

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057770126.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.80000	`XP_057770126.1`
3	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.60000	`XP_057770126.1`
4	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.60000	`XP_057770126.1`
5	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	0.40000	`XP_057770126.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:45188468`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B111,B65,B90,B92
`Chr6:45190607`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B15,C3,C31,C43
`Chr6:45191086`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr6:45192053`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B26
`Chr6:45192065`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr6:45192079`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B26
`Chr6:45192142`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B15,C3,C31,C43
`Chr6:45192239`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770126.1

506 aa

253

506

Ferrochelatase

PF00762 Ferrochelatase 93-416 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770126.1`	Pfam	`PF00762`	Ferrochelatase	Domain	93	416	1.8e-112	376.2	Ferrochelatase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914143.1
GAGCTTCAAAAGTGAGTATGTATGTGTAATATCCATTGTTTTAATCTGTGAGCGAGGGAAGGATAATCCGTGAAACACGTGGCCAAATGCCAATACACAAACAAAATAGCCACAGTGTTGAGCGACGATGCAGAGCTGGGTCCTCTATTTCCACAATCTTTTTGTGAAAAAGATTCTACTCCTTCGCTCTCTCTAGAATCTCGAGATGAGCCAATCCTCCATGAATATACGAATTCAAGCTCCTTCTCCTTCTCTACTAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989962
ATGAGCCAATCCTCCATGAATATACGAATTCAAGCTCCTTCTCCTTCTCTACTACTGCCACGAGCCAAAGTCTGCTATGTGCTACCATTTTCTCAGTTAGAAACTTTTTCCAATCCTAATCTTTTAAAGACATCCATAGTTGCAAGATGCCCCTTGGGGTGGTCCAAGACATCTTCTGTACTTGCAGAGCAATCGATCAAGCATTCAACACGATCAGGAGCCCTGGTTACCTCTGGCTCTCAAGAAACGTCCACCCCTGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770126.1
MSQSSMNIRIQAPSPSLLLPRAKVCYVLPFSQLETFSNPNLLKTSIVARCPLGWSKTSSVLAEQSIKHSTRSGALVTSGSQETSTPALVGNEKIGVLLLNLGGPETLDDVQPFLFNLFADPDIIRLPRLFRFLQKPLAQFISVARSRKSREGYASIGGGSPLRRITDAQAEELRKALCDKNVPAKVYVGMRYWHPFTEEAIEQIKRDGISKLVVLPLYPQFSISTSGSSLRLLESIFREDEYLVNMQHTVIPSWYQREGY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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