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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G003258`

染色体: Chr06 坐标: 45238160-45240869 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G003258`
名称	SmilChr06G003258
描述	rRNA biogenesis protein RRP36
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	45238160 - 45240869 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989971`
GeneID	`130989971`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989971`
原始查询	`SmilChr06G003258`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	rRNA biogenesis protein RRP36
产物	rRNA biogenesis protein RRP36
Arabidopsis	`AT1G60640` (AT1G60640) stress response protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842358] identity=55.3; qcov=0.188; evalue=1.23e-14; confidence=weak
Rice	`Os01g0505700` - identity=47.6; qcov=0.504; evalue=4.25e-25; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF12874 (zf-met)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989971

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057770139.1`
2	Nucleolus	核仁	1.00000	`XP_057770139.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057770139.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770139.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770139.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:45238353`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	34	A13,A23,A8,A9,B101,B106,B107,B109,B114,B23,B25,B29,B5,B64,B73,B78,B81,B85,B90,B92,C11,C12,C27,C32,C33,C37,C52,C57,C68,C69,C77,C85,D1,D2
`Chr6:45239047`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A24,B12,B66,C42,C78
`Chr6:45239056`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr6:45239168`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C21,C47,C50
`Chr6:45239193`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B115,B135,B67,B94,D5
`Chr6:45239209`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B108
`Chr6:45239209`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108
`Chr6:45240186`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr6:45240199`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18
`Chr6:45240305`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C13,C37

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770139.1

250 aa

125

250

zf-met

PF12874 zf-met 145-170 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770139.1`	Pfam	`PF12874`	zf-met	Domain	145	170	0.00018	22.4	Zinc-finger of C2H2 type

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914156.1
GCATTATTTATTAAAAAGAGAAAGATTAAAAAATGAAGACAAAATAGAAATAAAACACCCATCATTCTTCTTAAACCCTAATTCCCTTCTCCCTCGTCTGCATCTTCAATTCCAGAGTTTGCATCTTCAGTTCCAGAGTTTGGGACACAACAGCAGATTCAAGAAAAGCGGTGAGAAGAAGAGGCTATAATTATGATAAAAAGGCGATTCTATAGGTATGAACATGGTGATAAGGATGCTGCATCAGAATCTTCCTCGTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989971
ATGATAAAAAGGCGATTCTATAGGTATGAACATGGTGATAAGGATGCTGCATCAGAATCTTCCTCGTCTTCGTCAGGGTCCGAAGTAGAGGCAGAAGCTACTGATGCCACAGATATTGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGCAGAAGAAGAAAATGTTGCTTCAGATGTGAGAGAGAAGGGAGAAGCTTCGTCTTCTTCTGGTTATGAAAGCGAGGATAGCTCAGTGAACGAAGTTAATCTTGACTCATCAGGTTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770139.1
MIKRRFYRYEHGDKDAASESSSSSSGSEVEAEATDATDIEEEEEEEEEAEEENVASDVREKGEASSSSGYESEDSSVNEVNLDSSGLPTSDEDTDSSNWQRNHCRTRKFLWRRRKQFTYHSSGSPKKDETDFDTADCILRHKSVFKCRLCPRIVCLSEETLKAHLISKKHIRSEKLLREGRLKLMLNERGEIEGEVHYENNAPTTASGQKPDKPNKKGKGRLKQKKRPRQDTESRKAKPSTEKREKRRKN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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