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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G003260`

染色体: Chr06 坐标: 45256481-45257790 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G003260`
名称	SmilChr06G003260
描述	uncharacterized SmilChr06G003260
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	45256481 - 45257790 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989975`
GeneID	`130989975`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989975`
原始查询	`SmilChr06G003260`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	actin cross-linking protein, putative (DUF569) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822493]; symbol=AT3G28630; hit=AT3G28630; species=arabidopsis; confidence=high
产物	actin cross-linking protein, putative (DUF569) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822493]; symbol=AT3G28630; hit=AT3G28630; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G28630` (AT3G28630) actin cross-linking protein, putative (DUF569) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822493] identity=53.1; qcov=0.7; evalue=1.29e-51; confidence=high
Rice	`Os03g0801900` - identity=48.3; qcov=0.719; evalue=2.55e-41; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04601 (DUF569)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989975

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057770144.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057770144.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057770144.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057770144.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770144.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:45256818`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B90,B92
`Chr6:45256850`	`ACC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	103	A14,A15,A16,A19,A2,A20,A22,A24,A25,A5,A6,B1,B100,B102,B104,B107,B11,B110,B111,B112,B113,B115,B12,B120,B122,B124,B126,B127,B129,B134,B135,B14,B17,B18,B24,B25,B27,B3,B34,B36,B37,B38,B39,B4,B44,B49,B50,B51,B52,B53,B55,B57,B60,B66,B68,B69,B72,B79,B80,B81,B82,B84,B85,B88,B89,B9,B91,B94,C14,C17,C18,C2,C22,C25,C26,C27,C29,C32,C33,C34,C35,C38,C39,C42,C43,C50,C57,C59,C6,C68,C71,C74,C76,C78,C81,C84,C85,D10,D2,D4,D5,D7,D8
`Chr6:45256953`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B127,B44,C27,C59
`Chr6:45257027`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A24,B12,B66,C42,C78
`Chr6:45257081`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C46
`Chr6:45257102`	`ACG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C75
`Chr6:45257102`	`ACG`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C75
`Chr6:45257187`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A25,B86

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770144.1

210 aa

105

210

DUF569

PF04601 DUF569 1-142 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770144.1`	Pfam	`PF04601`	DUF569	Domain	1	142	5.3e-49	166.3	Beta-trefoil domain of unknown function (DUF569)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914161.1
TCATCACCATTTTGTTTACTATCAAAAATCATAGATAGATATTCCTTCACAAATCCCGGCCTTCATCGTCCAAAACCCCTGTGCATGCGTGAAGGCTTCCTTTTGCAGTTTCTGGCCCTTCAACCTCATTCCAGCCCTCCACTTTCTCTCTCCAAACTCTTCTCGGAGAGAGAGAGAGGGGCTAATAGGGCTTCACAAATATCACATTATTTCATGACAAGAGAAACTACTTTGTCAGACACTCACAAAAATAAAAGATG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989975
ATGGATTTCTTCCTTAGAGCAAGCACGGTGAGGCTGATCAGCTACAACGACAGATTCCTCGTGGCCGACGCCGACTGCGTCGGCGTCAGCCACGGCACCGACCGATACGCGAGGAACGCGGTTTGGTCGGTGGAAATAGTCGAAGGAAAGGAGTCCATCCGCCTGAAGAGCTGCCACGGGACGTACCTGACCGCCTCGGGCACGCCGGTGATGCCCGGCGTCACCGGGAAGAGGGTCGTCCAGACGTGGCCGTGCCAGTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770144.1
MDFFLRASTVRLISYNDRFLVADADCVGVSHGTDRYARNAVWSVEIVEGKESIRLKSCHGTYLTASGTPVMPGVTGKRVVQTWPCQYDSATEWEPSRDGMEVRLRSNVYGHFLRPNGSLTPWRNAVTHDVPHRSKSREKMLWDVEVVGRCPDQRRAASVRSRSRSRSRDFKKQDNEAGKRDGDGGGGGDGDEGLYDNVQCWWCAPSCLPF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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