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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G003261`

染色体: Chr06 坐标: 45258606-45262796 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G003261`
名称	SmilChr06G003261
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-3
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	45258606 - 45262796 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989974`
GeneID	`130989974`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989974`
原始查询	`SmilChr06G003261`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-3
产物	putative late blight resistance protein homolog R1A-3
Arabidopsis	`AT5G35450` (AT5G35450) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833508] identity=25.4; qcov=0.814; evalue=2.76e-48; confidence=low
Rice	`Os10g0183000` (OsLSR) - identity=26.7; qcov=0.624; evalue=1.02e-47; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989974

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057770141.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057770142.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057770141.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770141.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770141.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:45258696`	`T`	`TCC`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	A21
`Chr6:45258696`	`T`	`TCC`	2bp_insertion	CDS_variant	1	A21
`Chr6:45258705`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B79
`Chr6:45258708`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A21
`Chr6:45258708`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A21
`Chr6:45258722`	`C`	`CGG`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	A21
`Chr6:45258722`	`C`	`CGG`	2bp_insertion	CDS_variant	1	A21
`Chr6:45258881`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B33
`Chr6:45259008`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B127,B44,C27,C59
`Chr6:45259029`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B120
`Chr6:45259050`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,A23,C40
`Chr6:45259137`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770141.1

1084 aa

542

1084

NB-ARC

WHD_DRP

PF00931 NB-ARC 374-538 aa PF23559 WHD_DRP 623-693 aa

XP_057770142.1

1058 aa

529

1058

NB-ARC

WHD_DRP

PF00931 NB-ARC 397-512 aa PF23559 WHD_DRP 597-667 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770141.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	374	538	2.3e-42	145.2	NB-ARC domain
`XP_057770141.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	623	693	5.1e-17	62.4	Disease resistance protein Winged helix domain
`XP_057770142.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	397	512	5.9e-24	85.3	NB-ARC domain
`XP_057770142.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	597	667	4.8e-17	62.5	Disease resistance protein Winged helix domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914158.1
GAGTTGTTAGAACACAAAGTCAAATTAAATATTTGGGACACCAATTGCATTCCATCATTGACTTTAAAAGTCATCGGCCTTCATTGAAAAGTATTGTTACAAGTAAGACTTGCAGTCTTCATTCTCACAACGATGGATAAATCAGAGTCTTCCTCTCGACAAACTCTCTCAGAGATGTTCCAACATTTACATAAATGGAGGAACACGAGAAAGACCAAGAGGAGAGACCCTCTCAAATTCAAGTGGTCTCAGTTTCATCT...

XM_057914159.1
ATCGGCCTTCATTGAAAAGTATTGTTACAAGTAAGACTTGCAGTCTTCATTCTCACAACGATGGATAAATCAGAGTCTTCCTCTCGACAAACTCTCTCAGAGATGTTCCAACATTTACATAAATGGAGGAACACGAGAAAGACCAAGAGGAGAGACCCTCTCAAATTCAAGTGGTCTCAGTTTCATCTCTCTGTAGTCCACGGCTATGTCTTGAAGCTGAAGCTCAGCCCCGATTCCAAGCTGCTGCGCCTCGCCACCTC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130989974
ATGGATAAATCAGAGTCTTCCTCTCGACAAACTCTCTCAGAGATGTTCCAACATTTACATAAATGGAGGAACACGAGAAAGACCAAGAGGAGAGACCCTCTCAAATTCAAGTGGTCTCAGTTTCATCTCTCTGTAGTCCACGGCTATGTCTTGAAGCTGAAGCTCAGCCCCGATTCCAAGCTGCTGCGCCTCGCCACCTCGCTCAACCATGAATTCTCCGGCCTCGTGCCCGAAAACTCCGCTGAATACGACGGCAGAGT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057770141.1
MDKSESSSRQTLSEMFQHLHKWRNTRKTKRRDPLKFKWSQFHLSVVHGYVLKLKLSPDSKLLRLATSLNHEFSGLVPENSAEYDGRVASLAHALEEVFVVPEQHQLFERDEAVERDGLIAALMDMLLRLLHNRPGSVHSVEDRIEHLRKLLRFLLAVLGHDQQGGHDLLTEFETVANKAGSLVHLIVFSAEPDSISKSAEKGFGALLRRMEDLKSRIIKRRGVTEADATRKTAAAGDSLFIVDSLVDDLGDLLSRVGIAD...

XP_057770142.1
MDKSESSSRQTLSEMFQHLHKWRNTRKTKRRDPLKFKWSQFHLSVVHGYVLKLKLSPDSKLLRLATSLNHEFSGLVPENSAEYDGRVASLAHALEEVFVVPEQHQLFERDEAVERDGLIAALMDMLLRLLHNRPGSVHSVEDRIEHLRKLLRFLLAVLGHDQQGGHDLLTEFETVANKAGSLVHLIVFSAEPDSISKSAEKGFGALLRRMEDLKSRIIKRRGVTEADATRKTAAAGDSLFIVDSLVDDLGDLLSRVGIAD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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