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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G003276`

染色体: Chr06 坐标: 45341977-45346208 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G003276`
名称	SmilChr06G003276
描述	uncharacterized SmilChr06G003276
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	45341977 - 45346208 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989987`
GeneID	`130989987`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989987`
原始查询	`SmilChr06G003276`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0704400; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0704400; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G05850` (MUG7) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3768859] identity=27.8; qcov=0.55; evalue=1.78e-37; confidence=low
Rice	`Os06g0704400` - identity=33.8; qcov=0.628; evalue=6.75e-56; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00872 (Transposase_mut); PF10551 (MULE); PF26130 (PB1-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989987

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057770155.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770155.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770155.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057770155.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057770155.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:45343605`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr6:45343782`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr6:45343786`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	144	A1,A10,A13,A14,A15,A16,A18,A19,A2,A20,A22,A4,A5,A8,A9,B1,B100,B101,B110,B111,B114,B115,B117,B118,B119,B12,B121,B122,B126,B128,B130,B131,B134,B135,B139,B140,B17,B21,B22,B23,B25,B26,B27,B28,B3,B34,B35,B36,B4,B40,B42,B43,B48,B49,B50,B51,B54,B55,B58,B59,B60,B62,B65,B66,B67,B68,B70,B71,B75,B76,B77,B78,B79,B82,B84,B85,B86,B87,B88,B9,B91,B95,B98,B99,C1,C10,C11,C13,C14,C15,C16,C18,C19,C20,C21,C22,C23,C27,C29,C30,C31,C33,C35,C37,C39,C4,C40,C43,C44,C45,C46,C47,C48,C5,C52,C53,C54,C55,C56,C58,C59,C60,C61,C62,C67,C68,C7,C70,C71,C73,C75,C78,C79,C80,C81,C85,C86,D1,D3,D4,D5,D6,D8,D9
`Chr6:45343804`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B134,C82
`Chr6:45343872`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B27,D4
`Chr6:45343874`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	25	A20,A6,B104,B111,B139,B36,B48,B52,B56,B61,B79,B87,B88,B92,B94,B96,B98,C10,C14,C16,C24,C26,C28,C34,C73
`Chr6:45343875`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	157	A1,A10,A13,A14,A15,A16,A18,A19,A2,A22,A24,A4,A5,A8,A9,B1,B100,B101,B108,B110,B111,B114,B115,B117,B118,B119,B12,B122,B126,B128,B130,B131,B134,B135,B139,B14,B140,B17,B21,B22,B23,B25,B26,B27,B28,B3,B34,B35,B36,B4,B40,B42,B43,B44,B47,B48,B50,B51,B54,B55,B57,B58,B59,B60,B62,B65,B66,B67,B68,B69,B7,B70,B71,B73,B75,B76,B77,B78,B79,B82,B83,B84,B85,B86,B87,B88,B9,B91,B95,B98,B99,C1,C11,C13,C14,C15,C16,C17,C18,C19,C20,C21,C22,C23,C25,C27,C29,C30,C31,C33,C35,C37,C39,C4,C40,C43,C44,C45,C46,C47,C48,C5,C52,C53,C54,C55,C56,C58,C59,C60,C61,C62,C65,C67,C68,C69,C7,C70,C71,C72,C73,C74,C75,C76,C79,C80,C81,C82,C85,C86,D1,D3,D4,D5,D6,D8,D9
`Chr6:45343879`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B17,B73,B75,C81
`Chr6:45343884`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B118,B122,C48,C62
`Chr6:45343902`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B10,B134,C82
`Chr6:45343994`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C27
`Chr6:45344029`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C46

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770155.1

642 aa

321

642

PB1-like

MULE

Transposase_mut

PF26130 PB1-like 5-100 aa PF10551 MULE 541-635 aa PF00872 Transposase_mut 559-637 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770155.1`	Pfam	`PF26130`	PB1-like	Domain	5	100	3.3e-14	53.7	PB1-like domain
`XP_057770155.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	541	635	3.6e-15	56.8	MULE transposase domain
`XP_057770155.1`	Pfam	`PF00872`	Transposase_mut	Family	559	637	9.7e-05	22.1	Transposase, Mutator family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914172.1
GGTTAATTGCATGAAAATACACGAACTTTAGTCATTTTTCCATTCTGCACACGAACTTTAAAATTTACATTTTAAACCATGAACTTTGAATTCGTTCCAATTTTTCCTTAAAATTCATTTCCGGTCATCGGAAATCTTACGTGTCCTTAATAGTGCCAGTTGGATGTCTGACGTGTCACGACAAACACGACGTCGTTTTAATCGCGGTTGTCAAAACACCGCGTTTAGGCATGTGACGACGTCGTTTTACATAAGTCTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989987
ATGGCAGACAGTGACGACGAATTTGGGATTTATATACATCATGGGGGGAAATTTACTACCGTGGGGTGTGCAAGAATGTATCTTGGGGGTAAGGCAGATCTCAGCATGCAAGATAGGGATAGATTTGGTTTCTTTGATTTAGAGGAATTAGTGCGTGAATTTGGGTATGCGAGGTGGGATTGCCTTGCTTGGAAAGCACCTAGGACACTTGCATTTTTTGACATACACAATGATGCTGATGTTATGAAAATGCTTAATAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770155.1
MADSDDEFGIYIHHGGKFTTVGCARMYLGGKADLSMQDRDRFGFFDLEELVREFGYARWDCLAWKAPRTLAFFDIHNDADVMKMLNISLCKNKFCSVYVDKGELGSDKTVEQGSEKPLQLGKEKPLEMGKENAGEVEKGKTVGKGKEKLSRPEKKKVNKPVGTSPITRSKKVIDEGQGTVSVRTSPITRSRKVLGLGENSLPVETTPKKKGKEKQVTRTLVDEPIIETDPEDSDYILPEDGEQYEIDDSLGDNELGSDDE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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