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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G003280`

染色体: Chr06 坐标: 45357299-45360393 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G003280`
名称	SmilChr06G003280
描述	uncharacterized SmilChr06G003280
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	45357299 - 45360393 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989990`
GeneID	`130989990`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989990`
原始查询	`SmilChr06G003280`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os05g0103600; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os05g0103600; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G04710` (TPR10) ankyrin repeat family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819629] identity=32.5; qcov=0.979; evalue=5.45e-60; confidence=low
Rice	`Os05g0103600` - identity=33.3; qcov=0.984; evalue=3.68e-60; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00023 (Ank); PF12796 (Ank_2); PF13606 (Ank_3); PF13637 (Ank_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989990

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057770157.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057770157.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057770157.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770157.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770157.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:45357636`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr6:45357805`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B10
`Chr6:45357820`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B86,C3
`Chr6:45357845`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A8,B138,C44
`Chr6:45357863`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B22,B51,C41
`Chr6:45357871`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B117,C37
`Chr6:45358023`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	23	A4,B101,B107,B115,B140,B26,B33,B37,B40,B41,B50,B67,B69,B89,B94,C12,C22,C4,C51,C54,C61,C62,C69
`Chr6:45358027`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	22	A4,B101,B107,B115,B140,B26,B33,B37,B40,B41,B50,B67,B69,B89,B94,C12,C22,C4,C51,C61,C62,C69
`Chr6:45358044`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	25	A21,A4,B101,B107,B115,B127,B26,B33,B37,B40,B41,B50,B67,B69,B89,B94,C12,C22,C4,C41,C51,C54,C61,C62,C69
`Chr6:45358076`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	22	A21,B101,B115,B26,B33,B40,B48,B50,B85,B94,C12,C15,C2,C28,C29,C4,C41,C51,C52,C61,C72,D6
`Chr6:45358078`	`C`	`CAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	9	A2,A4,B109,B34,B48,B89,C52,C62,C69
`Chr6:45358079`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	22	A21,B101,B115,B26,B33,B40,B48,B50,B85,B94,C12,C15,C2,C28,C29,C4,C41,C51,C52,C61,C72,D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770157.1

437 aa

218

437

Ank_2

Ank_3

Ank

Ank_4

Ank

Ank_4

Ank_2

Ank

Ank_2

Ank

PF12796 Ank_2 42-111 aa PF13606 Ank_3 49-77 aa PF00023 Ank 49-80 aa PF13637 Ank_4 53-103 aa PF00023 Ank 84-113 aa PF13637 Ank_4 88-136 aa PF12796 Ank_2 109-176 aa PF00023 Ank 116-140 aa PF00023 Ank 150-177 aa PF12796 Ank_2 182-241 aa PF00023 Ank 213-241 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770157.1`	Pfam	`PF12796`	Ank_2	Repeat	42	111	1.9e-33	115.6	Ankyrin repeats (3 copies)
`XP_057770157.1`	Pfam	`PF13606`	Ank_3	Repeat	49	77	1.1e-25	87.3	Ankyrin repeat
`XP_057770157.1`	Pfam	`PF00023`	Ank	Repeat	49	80	1.1e-35	120.3	Ankyrin repeat
`XP_057770157.1`	Pfam	`PF13637`	Ank_4	Repeat	53	103	1.3e-20	73.7	Ankyrin repeats (many copies)
`XP_057770157.1`	Pfam	`PF00023`	Ank	Repeat	84	113	1.1e-35	120.3	Ankyrin repeat
`XP_057770157.1`	Pfam	`PF13637`	Ank_4	Repeat	88	136	1.3e-20	73.7	Ankyrin repeats (many copies)
`XP_057770157.1`	Pfam	`PF12796`	Ank_2	Repeat	109	176	1.9e-33	115.6	Ankyrin repeats (3 copies)
`XP_057770157.1`	Pfam	`PF00023`	Ank	Repeat	116	140	1.1e-35	120.3	Ankyrin repeat
`XP_057770157.1`	Pfam	`PF00023`	Ank	Repeat	150	177	1.1e-35	120.3	Ankyrin repeat
`XP_057770157.1`	Pfam	`PF12796`	Ank_2	Repeat	182	241	1.9e-33	115.6	Ankyrin repeats (3 copies)
`XP_057770157.1`	Pfam	`PF00023`	Ank	Repeat	213	241	1.1e-35	120.3	Ankyrin repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914174.1
TAAATAAGCTGCAGCGGTTACAATAGAATCAAGTTTCTCTCACACATTCAACAACTCACAACTTCAACGCCATGGATTCTACTTCTGAAATTGGTGCATTGATCATCGAAGCTGGTGCTAGTGGAGACCTTAAAAAACTTAAAGAGATGAGAAGGAAGGTTGGTGATGACACAGAGTTGAGGAGAATATGTGATGTATACACTGACTTCTCCACAGGCCGGTGTGTGTTGCATCACGCTGCTGAAATCGGACATTTTCAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989990
ATGGATTCTACTTCTGAAATTGGTGCATTGATCATCGAAGCTGGTGCTAGTGGAGACCTTAAAAAACTTAAAGAGATGAGAAGGAAGGTTGGTGATGACACAGAGTTGAGGAGAATATGTGATGTATACACTGACTTCTCCACAGGCCGGTGTGTGTTGCATCACGCTGCTGAAATCGGACATTTTCAGATTTGCAAATTCTTGATTCACAACCTCAAAGTCCACATCGATGCCCGGACTTTCACCAGGGATACTCCTCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770157.1
MDSTSEIGALIIEAGASGDLKKLKEMRRKVGDDTELRRICDVYTDFSTGRCVLHHAAEIGHFQICKFLIHNLKVHIDARTFTRDTPLIAAAKGEHVKIVEYLINQGASVSSANSKGSTALHYAVLKDNRELMELLVTKGALLEVDSMDGTPLQIALSRVNVETVKFLLSHGAKPNICSLVLESPLVLAIKAHSFECFDLLLKARADPNMYIVGFSPLSYAAKVGDTKFLKSLLDAGADPNSSLIGHVKIIEDAALVRDRE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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