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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G003281`

染色体: Chr06 坐标: 45361222-45366227 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G003281`
名称	SmilChr06G003281
描述	histone deacetylase 19-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	45361222 - 45366227 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989989`
GeneID	`130989989`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989989`
原始查询	`SmilChr06G003281`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	histone deacetylase 19-like
产物	histone deacetylase 19-like
Arabidopsis	`AT4G38130` (HD1) histone deacetylase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829969] identity=85.8; qcov=0.89; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0583400` (HDAC1) - identity=75.2; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004407 (histone deacetylase activity); GO:0016575 (GO:0016575)
KEGG	smil03082 (ATP-dependent chromatin remodeling - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil03083 (Polycomb repressive complex - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00850 (Hist_deacetyl)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989989

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057770156.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057770156.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057770156.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770156.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770156.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:45361474`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	62	A22,A25,B1,B10,B103,B11,B113,B114,B118,B119,B126,B127,B138,B14,B15,B16,B20,B27,B32,B37,B41,B44,B45,B53,B62,B63,B64,B65,B68,B69,B7,B72,B77,B86,B87,B89,B9,B97,B99,C11,C16,C21,C28,C32,C38,C43,C45,C46,C49,C5,C50,C51,C54,C55,C59,C68,C69,C7,C70,C78,C79,C83
`Chr6:45361652`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B118
`Chr6:45361653`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B95
`Chr6:45361698`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B140,B33,B56,B96,C48
`Chr6:45361868`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B95
`Chr6:45361984`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B10
`Chr6:45362679`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:45363559`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B5,C13,C52
`Chr6:45363873`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B66,B75,B82,C8
`Chr6:45364066`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr6:45364146`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C14
`Chr6:45364155`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,C54

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770156.1

499 aa

250

499

Hist_deacetyl

PF00850 Hist_deacetyl 36-324 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770156.1`	Pfam	`PF00850`	Hist_deacetyl	Domain	36	324	3.7e-88	296.4	Histone deacetylase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914173.1
CCACCTTTTGGCTTGTAGACCTAGTTGTGATGCTCGGTTCGGAAGACGTCGTCATGTACCCCCTTCGGAGGTATTCTTCGTCCATTTCAAAGAATGGACGTCTCCACCGACAGAAGCAAATCGTTCAGATTCGAAGAGGATGCACCAAACCGAGAAGTATTTGTAGTATTTAAATGAATAGGGGTGAGCTGAATGGGGCAGAAAAAGCGGATCGTCCTGATCTCATACATTGGAGTCTCATATTGGTCTTGTACAAGACC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989989
ATGGATACTGGAGGTAACTCTTTACCGTCTGGAGCAGACGGGTCGAAAAGAAAAGTGTGCTATTTCTACGACCCTGAGGTTGGAAATTACTATTACGGCCAAGGTCATCCGATGAAGCCCCATAGAATGCGCATGACTCATGCTCTTCTCGCACATTACGGGTTGCTGCAAAACATGCATGTCTTGAAGCCAAACCCTGCTCGAGATAAGGATCTTTGCAGGTTTCACGCAGATGATTACGTCTCTTTCTTGAGAAGAAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770156.1
MDTGGNSLPSGADGSKRKVCYFYDPEVGNYYYGQGHPMKPHRMRMTHALLAHYGLLQNMHVLKPNPARDKDLCRFHADDYVSFLRRITPETQQDQLRQLKRFNVGEDCPVFDGLYSFCQTYAGGSIGGAVKLNHGHCDIAINWAGGLHHAKKCEASGFCYVNDIVLAILELLKTHERVLYVDIDIHHGDGVEEAFYITDRVMTVSFHKFGDYFPGTGDIRDIGFGKGKYYALNVPLDDGIDDESYQSLFKPIISKVMEVY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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