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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G003282`

染色体: Chr06 坐标: 45366920-45371244 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G003282`
名称	SmilChr06G003282
描述	E3 ubiquitin-protein ligase RGLG3
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	45366920 - 45371244 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989994`
GeneID	`130989994`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989994`
原始查询	`SmilChr06G003282`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	E3 ubiquitin-protein ligase RGLG3
产物	E3 ubiquitin-protein ligase RGLG3
Arabidopsis	`AT5G63970` (RGLG3) Copine (Calcium-dependent phospholipid-binding protein) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836518] identity=68.1; qcov=0.864; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0960500` - identity=66; qcov=0.892; evalue=1.84e-178; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF07002 (Copine); PF13920 (zf-C3HC4_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989994

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057770161.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057770161.1`
3	Vesicle	囊泡	0.20000	`XP_057770161.1`
4	Endosome	内体	0.20000	`XP_057770161.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057770161.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:45368061`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B136,B57,C58
`Chr6:45368064`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C14
`Chr6:45368116`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C14
`Chr6:45368930`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A8,B17,B63,C20
`Chr6:45369634`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B75,B82,C8
`Chr6:45369897`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B64
`Chr6:45370021`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B10,B114
`Chr6:45370103`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B75,B82,C49,C8
`Chr6:45370556`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770161.1

425 aa

212

425

Copine

zf-C3HC4_3

PF07002 Copine 118-330 aa PF13920 zf-C3HC4_3 378-419 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770161.1`	Pfam	`PF07002`	Copine	Domain	118	330	2.5e-71	240.3	Copine
`XP_057770161.1`	Pfam	`PF13920`	zf-C3HC4_3	Domain	378	419	2.4e-09	37.6	Zinc finger, C3HC4 type (RING finger)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914178.1
ATTCAGCCGCACTTTTCAGACCATATAAATATCCAGTAAAATAGCATGCGCTAATGCTATACACCAACTACTACAGCTGTTGCCGAAGCTTGCAAGTTTAGCCATCTTCCCCACTTTCCCATTCTTGCTTCTTTTGCTGCACCAATTAAGGAACACAAACTGCAGAGTTTTCTGTTATTGAGTCGACATAAACTGCCACGTGATGGGAAACAGCGAATCATCACCTGAAGATGAATATGAAAATTTTTCACGTCAACCGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989994
ATGGGAAACAGCGAATCATCACCTGAAGATGAATATGAAAATTTTTCACGTCAACCGGCTGTACACGGAGGATACACGGTTGATGCTGGCTACAGACCTCAATCTCCAGAGCATGCCACCAGTTCGACACCATCTAGTTATCAGCATCATATCCCGTCAGATACAACAACTTCGACGAGTACTAGCTATAGGAAGAAACAGCACTCTGCATACATAGCAGATAACTTCAACTCTTTGGACGAGGTTATCAATGCATTAAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770161.1
MGNSESSPEDEYENFSRQPAVHGGYTVDAGYRPQSPEHATSSTPSSYQHHIPSDTTTSTSTSYRKKQHSAYIADNFNSLDEVINALREAGLESSNLILGIDFTKSNEWTGKYSFHRKSLHAIGSTPNPYEQAISIIGRTLSPFDEDNLIPCFGFGDATTHDQHVFSFYPDHRPCNGFEEALARYREIVPLLNLSGPTSFAPVIDAAVHIVEKSNFQYHVLVIIADGQVTRSPDTLPGKLSPQEQATINSVVAASEYPLSI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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