当前解析结果
SmilChr06G003285| 统一新 Gene ID | SmilChr06G003285 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G003285 |
| 描述 | uncharacterized protein At1g10890 |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 45393092 - 45395745 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130989999 |
|---|---|
| GeneID | 130989999 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130989999 |
| 原始查询 | SmilChr06G003285 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | arginine/glutamate-rich 1 protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831175]; symbol=AT5G13340; hit=AT5G13340; species=arabidopsis; confidence=medium |
| 产物 | arginine/glutamate-rich 1 protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831175]; symbol=AT5G13340; hit=AT5G13340; species=arabidopsis; confidence=medium |
| Arabidopsis | AT5G13340 (AT5G13340)arginine/glutamate-rich 1 protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831175] identity=63.3; qcov=0.793; evalue=8.88e-47; confidence=medium |
| Rice | Os11g0544200- identity=53.1; qcov=0.528; evalue=1.98e-24; confidence=medium |
| GO | GO:0005654 (nucleoplasm); GO:0005739 (mitochondrion); GO:0045296 (cadherin binding) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF15346 (ARGLU) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130989999 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057770164.1 |
| 2 | Nucleoplasm | 核质 | 1.00000 | XP_057770164.1 |
| 3 | Nuclear speckle | 核斑点 | 0.80000 | XP_057770164.1 |
| 4 | Nuclear body | 核内小体 | 0.40000 | XP_057770164.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.20000 | XP_057770164.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr6:45393247 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B34 |
Chr6:45393265 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B120,B71,B74,C80 |
Chr6:45393286 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A2,C41,D10 |
Chr6:45394760 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A2 |
Chr6:45395416 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A18,B64,C1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057770164.1PF15346
ARGLU 119-269 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057770164.1 |
Pfam | PF15346 |
ARGLU | Coiled-coil | 119 | 269 | 1.1e-32 | 113.6 | Arginine and glutamate-rich 1 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。