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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G003287`

染色体: Chr06 坐标: 45429592-45437275 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G003287`
名称	SmilChr06G003287
描述	CBS domain-containing protein CBSCBSPB3-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	45429592 - 45437275 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990001`
GeneID	`130990001`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990001`
原始查询	`SmilChr06G003287`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	CBS domain-containing protein CBSCBSPB3-like
产物	CBS domain-containing protein CBSCBSPB3-like
Arabidopsis	`AT3G52950` (AT3G52950) CBS / octicosapeptide/Phox/Bemp1 (PB1) domains-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824461] identity=67.9; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os12g0169400` (OsCBSCBSPB4) - identity=65; qcov=0.975; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00564 (PB1); PF00571 (CBS)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990001

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	0.40000	`XP_057770166.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057770166.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057770166.1`
4	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.20000	`XP_057770166.1`
5	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057770166.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:45430035`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B103,B12,C82
`Chr6:45430954`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B127,B140,B29,B54
`Chr6:45431877`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,B133
`Chr6:45432124`	`CAG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B140
`Chr6:45432124`	`CAG`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B140
`Chr6:45432131`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr6:45432132`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B140
`Chr6:45432132`	`G`	`GC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B140
`Chr6:45432134`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B140
`Chr6:45432134`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B140
`Chr6:45432144`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B140
`Chr6:45432144`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B140

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770166.1

551 aa

276

551

CBS

PB1

PF00571 CBS 67-114 aa PF00571 CBS 127-174 aa PF00571 CBS 235-283 aa PF00571 CBS 295-336 aa PF00564 PB1 414-495 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770166.1`	Pfam	`PF00571`	CBS	Domain	67	114	1.4e-37	128.5	CBS domain
`XP_057770166.1`	Pfam	`PF00571`	CBS	Domain	127	174	1.4e-37	128.5	CBS domain
`XP_057770166.1`	Pfam	`PF00571`	CBS	Domain	235	283	1.4e-37	128.5	CBS domain
`XP_057770166.1`	Pfam	`PF00571`	CBS	Domain	295	336	1.4e-37	128.5	CBS domain
`XP_057770166.1`	Pfam	`PF00564`	PB1	Domain	414	495	3.1e-16	59.8	PB1 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914183.1
GTATAAAAAATGGAAACCACAAAGAAATTTTTATGGAGGGAGTTGTTCTGCCACGATTGGGAAATATGGGGTCGAATTTTCATTTTACAAAAATTTTGGCTAAGACTTGAAGAAACAAATCAAGAGAGCGAGAAGACAGAGGGTGGAGAGTGGTGGTTTAAGGCTTCTCCAAAATCGTGGAGGCCTTAAACACCTCAATCGATTCAAACACTTATTCACTTTCTTCAAAAATATTTCCGCCCTTCGAATTCGCCGAGATA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990001
ATGAGCGGTGTGATTGGTCCGACGGCGGCAACGAGACGCAACAGTATGGCCCAGAAGCGCAACCCCTCCTCCACCGTGAAGCGGTCTTCGGGGCCTTCATCGGAGAACGGCTCCGCCGCTAATGGCACCAACGTCAAGCCCTCTTCCCCTCCTCACTTGTCTACTGCTGGTGAGAGAACAGTGAAGAAGCTTCGGTTATCCAAGGCACTCACAATTCCCGAGGGGACCACTGTATTAGATGCCTGTAGAAGAATGGCCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770166.1
MSGVIGPTAATRRNSMAQKRNPSSTVKRSSGPSSENGSAANGTNVKPSSPPHLSTAGERTVKKLRLSKALTIPEGTTVLDACRRMAARRVDAVLLTDANALLSGIVTDKDIATRVIAEELRPEQTLISKVMTRNPTFVSSDSLAIDALQKMVQGKFRHLPVVENGEVIAILDITKCLYDAISRMEKAAEQGSAIAAAVEGVERQFGSNFSASSALIETLRERMFKPSLSTIISETSRVATVSPSDPVYVAAKRMRESRVN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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