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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G003292`

染色体: Chr06 坐标: 45476004-45477720 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G003292`
名称	SmilChr06G003292
描述	probable aspartic proteinase GIP2
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	45476004 - 45477720 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990008`
GeneID	`130990008`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990008`
原始查询	`SmilChr06G003292`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable aspartic proteinase GIP2
产物	probable aspartic proteinase GIP2
Arabidopsis	`AT1G03220` (AT1G03220) Eukaryotic aspartyl protease family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838517] identity=43.5; qcov=0.993; evalue=2.44e-98; confidence=medium
Rice	`Os05g0403000` - identity=38.3; qcov=0.958; evalue=1.75e-86; confidence=medium
GO	GO:0004190 (aspartic-type endopeptidase activity); GO:0006508 (proteolysis)
KEGG	-
Pfam	PF14541 (TAXi_C); PF14543 (TAXi_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990008

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.80000	`XP_057770176.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.40000	`XP_057770176.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057770176.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057770176.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770176.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:45476282`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	A18
`Chr6:45476282`	`T`	`TC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	A18
`Chr6:45476371`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B127
`Chr6:45476425`	`T`	`TCG`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	B31,B35,B77
`Chr6:45476425`	`T`	`TCG`	2bp_insertion	CDS_variant	3	B31,B35,B77
`Chr6:45476429`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	5	B100,B123,B87,B9,D9
`Chr6:45476429`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	5	B100,B123,B87,B9,D9
`Chr6:45476446`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B31,B35,B77
`Chr6:45476523`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B75,C56,C61,D7
`Chr6:45476690`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B16
`Chr6:45476723`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	97	A1,A11,A13,A15,A19,A2,A21,A22,A24,A25,A3,A4,A7,A8,A9,B1,B102,B103,B106,B107,B108,B109,B110,B117,B121,B125,B126,B128,B129,B13,B131,B132,B135,B140,B20,B22,B24,B25,B27,B28,B29,B32,B36,B39,B45,B48,B49,B50,B51,B53,B55,B57,B58,B59,B62,B63,B66,B70,B71,B78,B85,B93,B94,B97,B99,C1,C12,C20,C21,C23,C26,C27,C28,C31,C4,C45,C47,C49,C53,C55,C57,C58,C64,C71,C72,C73,C78,C83,C87,C9,D1,D10,D2,D3,D4,D6,D8
`Chr6:45476730`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	96	A1,A11,A13,A15,A19,A2,A21,A22,A24,A25,A3,A4,A7,A8,A9,B102,B103,B106,B107,B108,B109,B110,B117,B121,B125,B126,B128,B129,B13,B131,B132,B135,B140,B20,B22,B24,B25,B27,B28,B29,B32,B36,B39,B45,B48,B49,B50,B51,B53,B55,B57,B58,B59,B62,B63,B66,B70,B71,B78,B85,B93,B94,B97,B99,C1,C12,C20,C21,C23,C26,C27,C28,C31,C4,C45,C47,C49,C53,C55,C57,C58,C64,C71,C72,C73,C78,C83,C87,C9,D1,D10,D2,D3,D4,D6,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770176.1

433 aa

216

433

TAXi_N

TAXi_C

PF14543 TAXi_N 43-215 aa PF14541 TAXi_C 253-417 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770176.1`	Pfam	`PF14543`	TAXi_N	Domain	43	215	7.1e-29	101.9	Xylanase inhibitor N-terminal
`XP_057770176.1`	Pfam	`PF14541`	TAXi_C	Domain	253	417	6.6e-54	182.8	Xylanase inhibitor C-terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914193.1
AATAAGTCTTAAATTCACATAGAATCGAACGCCAATATATATCATCACTTGAGTAGTTTATTACATAATGTTATTATATTAACACCAACAACCATATGGTATATTAATTATATATATATCGATCAGTGGATTTAAAGGGGAGAAATAAACAATAGATTCAATTGGGAGACTAACCTGAATATGATTTGAATATACTAATGCCGATTAGCTGGCATCCCATTCCAAAACTCAATAAATAAAACATGCATCAAATCCAAGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990008
ATGGCTTTCCCTAGTGTTTCGATCTTGATAACTTCCTCGTTTCTCCTTTTATCTTTCTTTTCAAATGCTCTAACATCCCCTAAAGCCTTCATTTTCCCAATAAGGAAAGATGGCGCAACCAACCAATACTACACGACTATCCAAATAGGCTCCAATGCCACCACACTGAACGTGGGGATCGATCTCGGCGGCAATTTCCTGTGGTTCAACTCCCTCGACTACTTCTCCGCCGCCGACTCCTACCGCCCCATCCTCTGCGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770176.1
MAFPSVSILITSSFLLLSFFSNALTSPKAFIFPIRKDGATNQYYTTIQIGSNATTLNVGIDLGGNFLWFNSLDYFSAADSYRPILCGTNQCRIANGVGCVFCFLSPPVPGCTNNTCSDYALNPFTGTQVYSGLGQDVLRVSSTRATQYEVKRFPFQFSPYPDFREGLATSTVGLLALGRTRVSLPSQLSSAFKISDKFALCIPSSGGNGNMIIGDEVYRKPFQQISEAIQTTPLLRNPVSNSGNEVVGNLSIAYFIDVKS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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