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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G003294`

染色体: Chr06 坐标: 45480129-45487773 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G003294`
名称	SmilChr06G003294
描述	cyclin-dependent kinase E-1
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	45480129 - 45487773 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990009`
GeneID	`130990009`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990009`
原始查询	`SmilChr06G003294`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cyclin-dependent kinase E-1
产物	cyclin-dependent kinase E-1
Arabidopsis	`AT5G63610` (CDKE;1) cyclin-dependent kinase E;1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836481] identity=75.6; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os10g0580300` (CDKE) - identity=73.2; qcov=1.03; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004693 (cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0006468 (protein phosphorylation); GO:0008353 (RNA polymerase II CTD heptapeptide repeat kinase activity); GO:0016592 (mediator complex)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990009

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057770177.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057770177.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057770177.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770177.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770177.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:45480326`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C1,C31,C45,C70
`Chr6:45480373`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr6:45480391`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B86,B95,C24,C61
`Chr6:45482631`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A24,C42
`Chr6:45483204`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A24,B33,C42,C48,D11
`Chr6:45485112`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr6:45487057`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A24,C42,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770177.1

471 aa

236

471

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF00069 Pkinase 23-331 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 27-230 aa

XP_057770178.1

471 aa

236

471

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF00069 Pkinase 23-331 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 27-230 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770177.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	23	331	2.8e-68	230.9	Protein kinase domain
`XP_057770177.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	27	230	1.5e-33	116.9	Protein tyrosine and serine/threonine kinase
`XP_057770178.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	23	331	2.8e-68	230.9	Protein kinase domain
`XP_057770178.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	27	230	1.5e-33	116.9	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914195.1
CAAACGCGACATACAGCGGTTTCAATTGTATAAATAGACGTAAATACTCTTCTTTCCCGGCCATTGCCAAAGCTTGGATCGGAGATGGTTTTCCCCAAAAATTTCAGTTTCAATTTCAGGTGCTGAAACATAACCATCACATATCGCAACACAATAAGAAAAAAAGTAATTGAATCGCGTATATGGGGGACGGAAGAGTGAGCAATTCGGGAAGCAACAGCAGTAGCAAGCCGGAGTGGCTGGAGCAGTACGACGTGATC...

XM_057914194.1
CAAACGCGACATACAGCGGTTTCAATTGTATAAATAGACGTAAATACTCTTCTTTCCCGGCCATTGCCAAAGCTTGGATCGGAGATGGTTTTCCCCAAAAATTTCAGTTTCAATTTCAGGTGCTGAAACATAACCATCACATATCGCAACACAATAAGAAAAAAAGTAATTGAATCGCGTATATGGGGGACGGAAGAGTGAGCAATTCGGGAAGCAACAGCAGTAGCAAGCCGGAGTGGCTGGAGCAGTACGACGTGATC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130990009
ATGGGGGACGGAAGAGTGAGCAATTCGGGAAGCAACAGCAGTAGCAAGCCGGAGTGGCTGGAGCAGTACGACGTGATCGGCAAAATCGGGGAAGGAACCTATGGCCTTGTTTTCTTGGCCAAGATAAAGTCCAACCGTTCCAAATCCATAGCCATCAAGAAGTTCAAGCAGTCCAAGGACGGTGACGGCGTCTCTCCCACCGCAATTCGAGAAATCATGTTGCTTAGGGAGATTTCTCATGAGAACGTGGTAAAGCTTGC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057770177.1
MGDGRVSNSGSNSSSKPEWLEQYDVIGKIGEGTYGLVFLAKIKSNRSKSIAIKKFKQSKDGDGVSPTAIREIMLLREISHENVVKLANVHINHTDMSLYLAFDYAEHDLYEIIRHHRDKVNQSINQYTIKSILWQLLNGLNYLHSNWIVHRDLKPSNILVMGDGEEHGVVKIADFGLARIYQAPLKPLSENGVVVTIWYRAPELLLGAKHYTSAVDMWAVGCIFAELLTLKPLFQGQEVKGTPNPFQLDQLDRIFKVLGH...

XP_057770178.1
MGDGRVSNSGSNSSSKPEWLEQYDVIGKIGEGTYGLVFLAKIKSNRSKSIAIKKFKQSKDGDGVSPTAIREIMLLREISHENVVKLANVHINHTDMSLYLAFDYAEHDLYEIIRHHRDKVNQSINQYTIKSILWQLLNGLNYLHSNWIVHRDLKPSNILVMGDGEEHGVVKIADFGLARIYQAPLKPLSENGVVVTIWYRAPELLLGAKHYTSAVDMWAVGCIFAELLTLKPLFQGQEVKGTPNPFQLDQLDRIFKVLGH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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