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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000003`

染色体: Chr07 坐标: 3735-9374 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000003`
名称	SmilChr07G000003
描述	uncharacterized SmilChr07G000003
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	3735 - 9374 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991190`
GeneID	`130991190`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991190`
原始查询	`SmilChr07G000003`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os11g0264500; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os11g0264500; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G67550` (AT5G67550) uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836891] identity=27.4; qcov=0.965; evalue=2.98e-52; confidence=low
Rice	`Os11g0264500` - identity=34.2; qcov=0.705; evalue=1.2e-54; confidence=low
GO	GO:0016020 (membrane)
KEGG	-
Pfam	PF29008 (DDB_G0292058_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991190

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057771263.1`
2	Dendrite	Dendrite	0.20000	`XP_057771263.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057771264.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771264.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771264.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:4161`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	103	A16,A19,A21,A4,A7,B103,B105,B111,B112,B120,B122,B123,B124,B125,B126,B127,B128,B130,B133,B134,B139,B14,B15,B2,B23,B24,B25,B27,B30,B31,B34,B37,B40,B47,B49,B5,B57,B58,B60,B61,B62,B63,B64,B65,B66,B7,B71,B73,B75,B76,B77,B79,B8,B83,B87,B89,B95,B97,B98,B99,C1,C13,C17,C18,C24,C25,C28,C29,C31,C33,C35,C36,C4,C40,C42,C43,C44,C45,C48,C50,C51,C53,C55,C56,C57,C59,C60,C62,C65,C7,C70,C76,C79,C80,C83,C84,C86,C87,C9,D1,D4,D6,D9
`Chr7:4248`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B49,C75
`Chr7:4710`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C53
`Chr7:4717`	`G`	`GCT`	2bp_insertion	frameshift_variant	9	A4,B15,B34,B40,B5,C28,C33,C53,C55
`Chr7:4736`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C18
`Chr7:4738`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	D7
`Chr7:4738`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr7:4755`	`G`	`GAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	95	A16,A18,A19,A21,A4,A7,B103,B105,B112,B120,B122,B123,B124,B126,B127,B128,B130,B132,B133,B134,B14,B15,B2,B22,B23,B24,B25,B30,B34,B40,B47,B49,B5,B57,B58,B60,B61,B62,B63,B64,B65,B66,B7,B71,B73,B75,B76,B77,B79,B83,B87,B89,B95,B97,B98,B99,C1,C13,C17,C18,C24,C25,C28,C29,C31,C33,C35,C36,C4,C40,C42,C43,C45,C48,C50,C55,C56,C59,C60,C62,C65,C7,C70,C76,C79,C80,C83,C84,C86,C87,C9,D1,D4,D7,D9
`Chr7:6086`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr7:6847`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771263.1

516 aa

258

516

DDB_G0292058_C

PF29008 DDB_G0292058_C 114-352 aa

XP_057771265.1

457 aa

228

457

DDB_G0292058_C

PF29008 DDB_G0292058_C 54-293 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771263.1`	Pfam	`PF29008`	DDB_G0292058_C	Domain	114	352	2.2e-10	40.7	DDB_G0292058-like C-terminal domain
`XP_057771265.1`	Pfam	`PF29008`	DDB_G0292058_C	Domain	54	293	1.5e-10	41.3	DDB_G0292058-like C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915281.1
TCAAATTTCAATTTTTTTTTTTTTTTGGTTTTTTCTTTTCGTTTTGTCGTTGACAAAGGGAAAACAAACAACATGCAGATTCTTCATCAAGAAGCCAGGGAAGATAATTCCTTTGTTTCACAGAATCTGCATAAAACAATCCATTACAGTTTGAGCTGGTACTCAAATTGGCTTCCCTGAGCAACACTTGAAAAGCAAAGGACAAGAAACTCGAGCTCAGAGGAAAAAGGAGTAGCAGTTCATTTCCCAGTAAAAGAAAT...

XM_057915280.1
TCAAATTTCAATTTTTTTTTTTTTTTGGTTTTTTCTTTTCGTTTTGTCGTTGACAAAGGGAAAACAAACAACATGCAGATTCTTCATCAAGAAGCCAGGGAAGATAATTCCTTTGTTTCACAGAATCTGCATAAAACAATCCATTACAGTTTGAGCTGGTACTCAAATTGGCTTCCCTGAGCAACACTTGAAAAGCAAAGGACAAGAAACTCGAGCTCAGAGGAAAAAGGAGTAGCAGTTCATTTCCCAGTAAAAGAAAT...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC130991190
ATGGGAACCTCTCGTGGAACAAAGATGATTCTCATTATGCTCGCCTTGAGCTTCATAAGAGTTGCCAGCTCTGAAGCAGGACGAGTTTTAACAGGATCGAACATGACCTCAGCAGGGAGTACAGATATGAATGAAACCATTAGAGTAGACCCTTTAAATAAATTGAAGAAATACAGAGGAGGATATAACGTAACAAATGACCATTACTGGAGTTCAACAGTATTTACAGGCATACCCGGGTATGCCATTGCACTAATATG...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057771263.1
MGTSRGTKMILIMLALSFIRVASSEAGRVLTGSNMTSAGSTDMNETIRVDPLNKLKKYRGGYNVTNDHYWSSTVFTGIPGYAIALIWLLCGLGYGILLLERTGCCKRGRKRKNKPSCYEQYHLQPLLLASFCTLLAVTACGLAFGGNSKSHSRAKTVIDILLDTADGASSTIFNITGAMKEISHNLQQVDDKTKKLINSTTIKLETQASSIKTHATENRQLIQNGLKTSYAVTTVTIALTLLVVISLLGFGVSKFQRPFQ...

XP_057771264.1
MGTSRGTKMILIMLALSFIRVASSEAGRVLTGSNMTSAGSTDMNETIRVDPLNKLKKYRGGYNVTNDHYWSSTVFTGIPGYAIALIWLLCGLGYGILLLERTGCCKRGRKRKNKPSCYEQYHLQPLLLASFCTLLAVTACGLAFGGNSKSHSRAKTVIDILLDTADGASSTIFNITGAMKEISHNLQQVDDKTKKLINSTTIKLETQASSIKTHATENRQLIQNGLKTSYAVTTVTIALTLLVVISLLGFGVSKFQRPFQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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