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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000006`

染色体: Chr07 坐标: 20331-22307 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000006`
名称	SmilChr07G000006
描述	rRNA-processing protein fcf2-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	20331 - 22307 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991195`
GeneID	`130991195`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991195`
原始查询	`SmilChr07G000006`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	rRNA-processing protein fcf2-like
产物	rRNA-processing protein fcf2-like
Arabidopsis	`AT5G30495` (AT5G30495) Fcf2 pre-rRNA processing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833073] identity=57.8; qcov=0.99; evalue=4.27e-70; confidence=high
Rice	`Os02g0730500` - identity=61.8; qcov=0.959; evalue=1.37e-75; confidence=high
GO	GO:0003723 (RNA binding); GO:0005730 (nucleolus); GO:0006396 (RNA processing)
KEGG	-
Pfam	PF08698 (Fcf2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991195

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057771274.1`
2	Nucleolus	核仁	1.00000	`XP_057771274.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771274.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771274.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057771274.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:20700`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B38,B39
`Chr7:21100`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B12
`Chr7:21278`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771274.1

194 aa

194

Fcf2

PF08698 Fcf2 65-160 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771274.1`	Pfam	`PF08698`	Fcf2	Family	65	160	7.6e-42	142.2	Fcf2 pre-rRNA processing

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915291.1
ATTCACATTCAGCTATTCTCGTGCGGCCCTAATTTAAAAAATACAGAATAGAAGAAGAAGGAGTTACGACCCTATCCCCTAATTTCAGTTCACAGCCGCTCTCACCGCGCCTCCAGTCGCCGGCAGCCATCGTCGCGTCTCCGCCCGACGCCGGCAGATTTTCCTCGCTGCGCCTCCTCCCCACCTCGACGCGCATCCAGTCGTGTCGCCGCTAGTCAGCAGAAGTTGCAAACTCACAGAAAAGCATGTCTGGCTCTGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991195
ATGTCTGGCTCTGAGAATAAGGCCGTAGGGCTTTCATGGCAACCTAAATTTGATTTATTTTCATCAACCAAAAAGGCAAAAACTCTGGCTGAAGAAGGTGCCCTCTACCAACCTCAATCTCAGCTCGTCGATGGCCTTTTCGTTCCTCCCAATGATCCCAGAAAGCTGAACAAATTGGCTAGGAAACAAGTCAAGGACACTGCTGGAAAGAATTGGTTTGATATGCCCGCACAAACTATAACCCCAGAGCTTAAAAAAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771274.1
MSGSENKAVGLSWQPKFDLFSSTKKAKTLAEEGALYQPQSQLVDGLFVPPNDPRKLNKLARKQVKDTAGKNWFDMPAQTITPELKKDLQLLKLRNVIDPKRHYKKGDSRSKTLPKYFQVGTVIESASEFFSGRLTKKERKQTLADELLADSTFHEYRKRKVREIEEKNRPAGVDKWKRSKFKKHGKSNGKKSRY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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