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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000007`

染色体: Chr07 坐标: 23315-26660 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000007`
名称	SmilChr07G000007
描述	grpE protein homolog 2, mitochondrial-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	23315 - 26660 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991196`
GeneID	`130991196`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991196`
原始查询	`SmilChr07G000007`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	grpE protein homolog 2, mitochondrial-like
产物	grpE protein homolog 2%2C mitochondrial-like
Arabidopsis	`AT4G26780` (AR192) Co-chaperone GrpE family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828785] identity=55.4; qcov=1.07; evalue=5.38e-101; confidence=high
Rice	`Os08g0338700` - identity=62.3; qcov=0.774; evalue=1.72e-95; confidence=high
GO	GO:0000774 (adenyl-nucleotide exchange factor activity); GO:0001405 (PAM complex, Tim23 associated import motor); GO:0006457 (protein folding); GO:0030150 (protein import into mitochondrial matrix); GO:0042803 (protein homodimerization activity); GO:0051082 (GO:0051082); GO:0051087 (protein-folding chaperone binding)
KEGG	-
Pfam	PF01025 (GrpE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991196

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057771275.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.60000	`XP_057771275.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057771275.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771275.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771275.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:23629`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C6
`Chr7:23652`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B129,B84
`Chr7:23897`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B13,B23,B46
`Chr7:24976`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C35
`Chr7:24976`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C35
`Chr7:24981`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	9	A18,A19,B138,B140,B44,B86,C15,C71,D5
`Chr7:26350`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,C23

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771275.1

305 aa

152

305

GrpE

PF01025 GrpE 125-297 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771275.1`	Pfam	`PF01025`	GrpE	Family	125	297	1e-44	152.8	GrpE

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915292.1
GTCCACAAATCGTAGTTTCATGTTATGTTGAGGGGTAATTAAGTCGATGTAAACCGAGCAACTCTACCTCCGCTTTAACTGCATTTCTTTTCTTTCTCCACAAGCCTAAAATCCCTCTAAAACCCTCTCGGCCTCCATCGCTCCACCACCACCATCACCATCACAGGCGTTTTCCCCTCCGATACAATCACCGCCACAGCCATGTCCTTCAGCAGAATAACTACCCGGTTCTCAAGAATCGTTTTGACTCGGTCCCGCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991196
ATGTCCTTCAGCAGAATAACTACCCGGTTCTCAAGAATCGTTTTGACTCGGTCCCGCAACTCGGAGCTCCTCTTCGGCCGCCCTGGAAGTAAACATTCCCAAACTTCGTCCAATTACTTCATTTCATCACGCAGAGTTAATGATATGGTGGTACCTGCTCAGATTTCTTCACTACATCATTCTGCGGTGAGTTCAGCAAACTTTCAATGGTTTGGATTCTCATCATCTGCATCCCCAGAGTCCAATGAGAAGGAGATGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771275.1
MSFSRITTRFSRIVLTRSRNSELLFGRPGSKHSQTSSNYFISSRRVNDMVVPAQISSLHHSAVSSANFQWFGFSSSASPESNEKEMMGQSGNEKENKESNEASSETEESISDEKNESDLESELSRDELVKLVVEKEQLLVKKQEEFEQMKDKVLRSFAEMENVKERTRRESENVKKFAIQNFAKSLLDVADNLGRASSAAKESFSKIDSSEDAAGAVKQLKTLLEGVEMTEKQLAEVFKKFGLEKYDPIEEEFDPNRHNA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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