当前解析结果
SmilChr07G000014| 统一新 Gene ID | SmilChr07G000014 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G000014 |
| 描述 | stress-response A/B barrel domain-containing protein HS1-like |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 74687 - 75583 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130991204 |
|---|---|
| GeneID | 130991204 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130991204 |
| 原始查询 | SmilChr07G000014 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | stress-response A/B barrel domain-containing protein HS1-like |
| 产物 | stress-response A/B barrel domain-containing protein HS1-like |
| Arabidopsis | AT3G17210 (HS1)heat stable protein 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820980] identity=52.5; qcov=0.953; evalue=3.25e-37; confidence=medium |
| Rice | Os01g0516600 (B1108H10.11-1)- identity=53; qcov=0.943; evalue=4.95e-36; confidence=medium |
| GO | GO:0009865 (pollen tube adhesion) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF07876 (Dabb) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130991204 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057771288.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.60000 | XP_057771288.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.40000 | XP_057771288.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057771288.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057771288.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057771288.1PF07876
Dabb 5-100 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057771288.1 |
Pfam | PF07876 |
Dabb | Domain | 5 | 100 | 1e-20 | 74.9 | Stress responsive A/B Barrel Domain |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。