当前解析结果
SmilChr07G000031| 统一新 Gene ID | SmilChr07G000031 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G000031 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G000031 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 139406 - 142774 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130991221 |
|---|---|
| GeneID | 130991221 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130991221 |
| 原始查询 | SmilChr07G000031 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130991221 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057771310.1 |
| 2 | Nucleoplasm | 核质 | 0.40000 | XP_057771310.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.20000 | XP_057771310.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057771310.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057771310.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:139708 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 34 | A1,A10,A11,A22,A8,A9,B110,B123,B129,B136,B137,B23,B26,B28,B49,B6,B72,B85,B86,B9,B98,B99,C25,C50,C53,C66,C77,C81,D1,D11,D2,D4,D6,D8 |
Chr7:139714 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A10,B2,B80,C40,C77 |
Chr7:139816 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B35 |
Chr7:139854 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B31,B40 |
Chr7:139925 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B77 |
Chr7:139936 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B3 |
Chr7:140122 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B94 |
Chr7:140220 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B108,B13,B53,C36 |
Chr7:140247 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B94 |
Chr7:140262 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B41 |
Chr7:140313 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B17,C51 |
Chr7:140316 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B108,B24,B53,C51,D11 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。