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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000034`

染色体: Chr07 坐标: 153187-160007 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000034`
名称	SmilChr07G000034
描述	G patch domain-containing protein TGH
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	153187 - 160007 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991224`
GeneID	`130991224`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991224`
原始查询	`SmilChr07G000034`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	G patch domain-containing protein TGH
产物	G patch domain-containing protein TGH
Arabidopsis	`AT5G23080` (TGH) SWAP (Suppressor-of-White-APricot)/surp domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832372] identity=56.7; qcov=0.929; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0489200` - identity=47; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003723 (RNA binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0006397 (mRNA processing)
KEGG	-
Pfam	PF01805 (Surp); PF07713 (DUF1604); PF26093 (HTH_TGH)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991224

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057771313.1`
2	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057771313.1`
3	Nuclear speckle	核斑点	0.60000	`XP_057771313.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771313.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771313.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:154035`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C65,D10
`Chr7:154093`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C59
`Chr7:156024`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr7:156081`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,B20,B5
`Chr7:156237`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr7:156245`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B102,B103,B19,B69,C38
`Chr7:157054`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B138,C18,D11
`Chr7:157055`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C65,D10
`Chr7:157070`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A14,B101,B89,C5,D5
`Chr7:157112`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C65,D10
`Chr7:157522`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A14,B101,B89,C5,D5
`Chr7:157648`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C65,D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771313.1

957 aa

478

957

DUF1604

Surp

HTH_TGH

PF07713 DUF1604 39-114 aa PF01805 Surp 395-458 aa PF26093 HTH_TGH 512-585 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771313.1`	Pfam	`PF07713`	DUF1604	Domain	39	114	2.6e-34	117.6	G patch domain-containing protein, N-terminal
`XP_057771313.1`	Pfam	`PF01805`	Surp	Domain	395	458	2.3e-12	47.0	Surp module
`XP_057771313.1`	Pfam	`PF26093`	HTH_TGH	Domain	512	585	1.6e-18	67.2	TGH-like, helix-turn-helix domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915330.1
TACACATATTGATACCCGGTTCACGGACCGGCCAGTTAGAAATCCGGCCAAAACCTCTTCTTCCGGCTCAACAAAGAAACTTGTTTCAATTCATTCAAGCATTTTATCGAACACTTAATCGAAGAAATTACACAGCACAGAAAAGGAGAAGAGAAAAATGGGCGACGAAGATGATTTTGTTTTCTACGGCACACCGATTGGCCGAGAAGAAGAATTCACCAGTCGCAAGAAGAAGGCGGTGGCGGAGGCTTCCGGTCAGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991224
ATGGGCGACGAAGATGATTTTGTTTTCTACGGCACACCGATTGGCCGAGAAGAAGAATTCACCAGTCGCAAGAAGAAGGCGGTGGCGGAGGCTTCCGGTCAGCTCAGAACCGCTCTTCCTCCGTGGAAACAAGAGGTGACAGATGAAGAGGGGCGGAGGAGGTTTCATGGAGCATTTACTGGTGGATATTCTGCTGGTTACTACAACACTGTTGGCTCCAAAGAAGGATGGACTCCACAATCATTTACGTCATCTCGGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771313.1
MGDEDDFVFYGTPIGREEEFTSRKKKAVAEASGQLRTALPPWKQEVTDEEGRRRFHGAFTGGYSAGYYNTVGSKEGWTPQSFTSSRKSRAEVTKQSIFNFLDEDEKADLEGRSLGSSMQFDTFGFTAAELARKEADKDQQQRPSAIPGPVPDELVVPATESIGVKLLIKMGWRPGRSIKDSNRNSLDVARRQARKAFLALSSDAGSETARSKLIEEDTGNDPDLPANDDDRFYKTVPAYVVDPKQDLHGLGYDPFKQAPE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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