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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000037`

染色体: Chr07 坐标: 162832-165573 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000037`
名称	SmilChr07G000037
描述	endochitinase EP3
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	162832 - 165573 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991231`
GeneID	`130991231`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991231`
原始查询	`SmilChr07G000037`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	endochitinase EP3
产物	endochitinase EP3
Arabidopsis	`AT3G54420` (EP3) homolog of carrot EP3-3 chitinase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824608] identity=69.3; qcov=0.993; evalue=4.49e-142; confidence=high
Rice	`Os02g0605900` (Cht6) - identity=66; qcov=0.895; evalue=6.25e-122; confidence=high
GO	GO:0004568 (chitinase activity); GO:0005975 (carbohydrate metabolic process); GO:0006032 (chitin catabolic process); GO:0008061 (chitin binding); GO:0016998 (cell wall macromolecule catabolic process)
KEGG	smil00520 (Amino sugar and nucleotide sugar metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00182 (Glyco_hydro_19); PF00187 (Chitin_bind_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991231

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell wall	细胞壁	0.40000	`XP_057771322.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.40000	`XP_057771322.1`
3	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057771322.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057771322.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771322.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:163072`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr7:163079`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C6
`Chr7:163100`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B100,B13,B137,D8
`Chr7:163109`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr7:163310`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B131,B74,B8,B99,D9
`Chr7:165085`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A15,A7,C78
`Chr7:165207`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B94,D9
`Chr7:165258`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C24
`Chr7:165287`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108
`Chr7:165424`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr7:165425`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B22,B47
`Chr7:165476`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	105	A1,A15,A18,A19,A2,A20,A6,A7,A8,B10,B100,B102,B106,B11,B113,B119,B120,B124,B126,B129,B131,B133,B134,B137,B19,B2,B23,B27,B3,B32,B33,B36,B40,B46,B47,B5,B52,B53,B54,B55,B56,B57,B58,B59,B60,B61,B62,B65,B66,B7,B70,B71,B74,B76,B77,B8,B80,B82,B85,B87,B88,B89,B91,B96,B98,B99,C1,C13,C15,C21,C23,C26,C28,C3,C30,C31,C32,C36,C40,C43,C49,C5,C53,C55,C56,C58,C60,C61,C63,C65,C68,C75,C80,C81,C84,C85,C87,D10,D11,D3,D4,D5,D6,D8,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771322.1

276 aa

138

276

Chitin_bind_1

Glyco_hydro_19

PF00187 Chitin_bind_1 31-62 aa PF00182 Glyco_hydro_19 77-276 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771322.1`	Pfam	`PF00187`	Chitin_bind_1	Domain	31	62	4.3e-09	37.2	Chitin recognition protein
`XP_057771322.1`	Pfam	`PF00182`	Glyco_hydro_19	Domain	77	276	1.4e-48	166.5	Chitinase class I

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915339.1
GGCCCGCCTTTTCCCCATTTCAAACTCGCCCACTTTCGCTATAAATATCCAACTCTTCTCCCTCACTAATTAAAAAACTCAAACCCCTCCAAAAAAATGGCTCTCTCCTCCGTTCAAAGAAGATCTCTTCTCTCTCTAGCGCTCTCAGCGATATTTCTCGCGGCGGCGACGCAAGTCTCCGGCCAAAACTGCGGCTGCGCGGAAAACCTGTGCTGCAGCCGGTGGGGATACTGCGGCACCGGCGACGACTACTGCGGCCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991231
ATGGCTCTCTCCTCCGTTCAAAGAAGATCTCTTCTCTCTCTAGCGCTCTCAGCGATATTTCTCGCGGCGGCGACGCAAGTCTCCGGCCAAAACTGCGGCTGCGCGGAAAACCTGTGCTGCAGCCGGTGGGGATACTGCGGCACCGGCGACGACTACTGCGGCCAGGGCTGCCAGTCGGGGCCGTGCTCCGCCGCGCCGCCCAGCAACGGCGTCTCCGTGGCGGATGTCGTGACCGACGCGTTCTTCGACGGCATCGCCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771322.1
MALSSVQRRSLLSLALSAIFLAAATQVSGQNCGCAENLCCSRWGYCGTGDDYCGQGCQSGPCSAAPPSNGVSVADVVTDAFFDGIADQAAGSCAGKGFYTRAAFLDALGSYPNFGTVGTTDDSKREIAAFFAHVTHETGHMCYIEEIDGASKDYCDETNTQYPCNPSKGYYGRGPIQLSWNFNYGPAGDSIGFDGINSPETVATDRVISFRTALWYWMNNCHNLIISGQGFGATIRAINGQLECDGANAATVNARVGYYT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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