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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000046`

染色体: Chr07 坐标: 194758-196528 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000046`
名称	SmilChr07G000046
描述	chitinase 5-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	194758 - 196528 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991242`
GeneID	`130991242`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991242`
原始查询	`SmilChr07G000046`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	chitinase 5-like
产物	chitinase 5-like
Arabidopsis	`AT3G54420` (EP3) homolog of carrot EP3-3 chitinase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824608] identity=53.7; qcov=1; evalue=5.03e-98; confidence=high
Rice	`Os04g0494100` (Cht5) - identity=56.5; qcov=0.978; evalue=1.7e-100; confidence=high
GO	GO:0004568 (chitinase activity); GO:0005975 (carbohydrate metabolic process); GO:0006032 (chitin catabolic process); GO:0008061 (chitin binding); GO:0016998 (cell wall macromolecule catabolic process)
KEGG	smil00520 (Amino sugar and nucleotide sugar metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00182 (Glyco_hydro_19); PF00187 (Chitin_bind_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991242

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057771336.1`
2	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057771336.1`
3	Cell wall	细胞壁	0.20000	`XP_057771336.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057771336.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771336.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:194994`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A14,B101,B107
`Chr7:195036`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B10,B82
`Chr7:195038`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B55
`Chr7:195085`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B10,B2,B82,D11
`Chr7:195087`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B10,B2,B82,D11
`Chr7:195144`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B101,B29,B46,B74
`Chr7:195162`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr7:195177`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B10,B2,B82,D11
`Chr7:195187`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B111,B16,B75,B9,B93
`Chr7:195199`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C18
`Chr7:195203`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr7:195213`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B10,B2,B82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771336.1

268 aa

134

268

Chitin_bind_1

Glyco_hydro_19

PF00187 Chitin_bind_1 24-56 aa PF00182 Glyco_hydro_19 67-212 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771336.1`	Pfam	`PF00187`	Chitin_bind_1	Domain	24	56	1.1e-06	29.5	Chitin recognition protein
`XP_057771336.1`	Pfam	`PF00182`	Glyco_hydro_19	Domain	67	212	1.6e-45	156.4	Chitinase class I

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915353.1
TTAGTTTTTCCCACACCAACACATCTACTCCCAAATGAAAAATCTCCTCACTCTCTTCACCCTTCTCGGCCTTCTTCTCGCCGCCGGAAAATGGGTTTCCGCTCAAAACTGCGGCTGCAGGTCCAACGAGTGCTGCAGCATCTACGGCTACTGCGGCACCGGTGACGACTACTGCGGCGGCAACTGCAGGTCGGGGCGGTGCCAACGACACAACGGAGTGAAATTTGCGGATGTCGTGACTGATGCTTTCTTCAATGGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991242
ATGAAAAATCTCCTCACTCTCTTCACCCTTCTCGGCCTTCTTCTCGCCGCCGGAAAATGGGTTTCCGCTCAAAACTGCGGCTGCAGGTCCAACGAGTGCTGCAGCATCTACGGCTACTGCGGCACCGGTGACGACTACTGCGGCGGCAACTGCAGGTCGGGGCGGTGCCAACGACACAACGGAGTGAAATTTGCGGATGTCGTGACTGATGCTTTCTTCAATGGGATCATGTCCAGTCAGGACCGCCGCAACTGCGCCGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771336.1
MKNLLTLFTLLGLLLAAGKWVSAQNCGCRSNECCSIYGYCGTGDDYCGGNCRSGRCQRHNGVKFADVVTDAFFNGIMSSQDRRNCAGKGFYTRARFIDAAASWPSFGSIGSTDDSKREIAAFFAHVAHESGRMCFIEEEGGKSKTYCDNTKEDWPCAANKRYYGRGPLQLTWNYNYGAAGQVVGFDGLKNPEILAVNPSMSIKAAVWFWMENCHAAFVSGNGFGATIRAINSVECDGRSPAQVNSRVNYYKDYCSQFRVD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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