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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000054`

染色体: Chr07 坐标: 236810-239121 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000054`
名称	SmilChr07G000054
描述	uncharacterized SmilChr07G000054
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	236810 - 239121 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991248`
GeneID	`130991248`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991248`
原始查询	`SmilChr07G000054`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824568]; symbol=PAS1; hit=AT3G54010; species=arabidopsis; confidence=low
产物	FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824568]; symbol=PAS1; hit=AT3G54010; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G54010` (PAS1) FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824568] identity=70.2; qcov=0.445; evalue=2.46e-22; confidence=low
Rice	`Os03g0367000` (OsFKBP72) - identity=68.4; qcov=0.445; evalue=2.49e-22; confidence=low
GO	GO:0003755 (peptidyl-prolyl cis-trans isomerase activity)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991248

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057771341.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057771341.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771341.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771341.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057771341.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:237210`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	C11,C16,C62
`Chr7:237210`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	3	C11,C16,C62
`Chr7:237218`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C11,C62
`Chr7:237219`	`T`	`TAG`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	C11,C62
`Chr7:237219`	`T`	`TAG`	2bp_insertion	CDS_variant	2	C11,C62
`Chr7:237221`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B126,B138,B33
`Chr7:237221`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B126,B138,B33
`Chr7:237229`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C11,C62
`Chr7:237457`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	10	A8,B129,B132,B136,B81,B83,C15,C59,D7,D8
`Chr7:237479`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	D2
`Chr7:237479`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	D2
`Chr7:237509`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	106	A13,A19,A22,A23,A3,B100,B102,B107,B109,B11,B111,B115,B117,B118,B125,B126,B127,B13,B130,B132,B133,B134,B136,B137,B138,B14,B15,B16,B18,B20,B24,B26,B3,B31,B33,B37,B4,B42,B43,B47,B49,B5,B56,B57,B58,B59,B60,B61,B62,B64,B65,B67,B68,B7,B70,B74,B77,B79,B82,B84,B85,B87,B90,B91,B92,B93,B94,B95,B96,B97,B98,B99,C13,C15,C16,C20,C22,C24,C27,C29,C35,C36,C39,C41,C44,C48,C5,C52,C57,C58,C59,C6,C63,C65,C7,C70,C72,C75,C76,C8,C83,C87,D1,D2,D5,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XR_009091110.1
AATTTATAAATTTTTCATCTTATTTTTCTTTTCTTTAAAAAAAAAAACTGCTTCTGCCATGCCTCTGTTTCCAAAAGCAAAGTGTTTAGAGGAGGTTCCCTTTTCTCTTCAATTTCTTTACCTACAGAACAACGAAAAATTCACCAAACTCTTGTCAATTCGATTCACCCAACACCAATAGATTCTTTAATTTCAACCCTTTCATTACATAACCAGATTTAGGAATTGGTTAAAAAGGTAAAGGGTTTCTGGATTGAACG...

XM_057915359.1
CCACCAAATTTATAAATTTTTCATCTTATTTTTCTTTTCTTTAAAAAAAAAAACTGCTTCTGCCATGCCTCTGTTTCCAAAAGCAAAGTGTTTAGAGGAGGTTCCCTTTTCTCTTCAATTTCTTTACCTACAGAACAACGAAAAATTCACCAAACTCTTGTCAATTCGATTCACCCAACACCAATAGATTCTTTAATTTCAACCCTTTCATTACATAACCAGATTTAGGAATTGGTTAAAAAGGTAAAGGGTTTCTGGAT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130991248
ATGACCAATAGACGACGAATGTGGCAGTCGGTGGAGGTATTAACGTTCCCGCCGGGGTTGGCCATGGAAGGGGGCACAACGACTATGGGTGTTCGACAACTTCAGCCGCGACAAATTCGATTGACTTGTTGTACCCTATTAATAACGAAGTATTGTTATTGGTATCAGGTTATATATCACTGTACAATATGGACACTAGATGGAGTTGTTGTTGAGTCGACTCGAGCAGAACATGGCGGCAATGGTATTCCAAAAAGACA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057771341.1
MTNRRRMWQSVEVLTFPPGLAMEGGTTTMGVRQLQPRQIRLTCCTLLITKYCYWYQVIYHCTIWTLDGVVVESTRAEHGGNGIPKRQVLGKTKIIFGFVEGFPTMLKGEVAMDGNPYWYQEEGACHIN

XP_057771342.1
MTNRRRMWQSVEVLTFPPGLAMEGGTTTMGVRQLQPRQIRLTCCTLLITKYCYWYQVIYHCTIWTLDGVVVESTRAEHGGNGIPKRQVLGKTKIIFGFVEGFPTMLKGEVAMDGNPYWYQEEGACHIN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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