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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000059`

染色体: Chr07 坐标: 267814-270133 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000059`
名称	SmilChr07G000059
描述	transcription factor bHLH104-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	267814 - 270133 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991244`
GeneID	`130991244`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991244`
原始查询	`SmilChr07G000059`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription factor bHLH104-like
产物	transcription factor bHLH104-like
Arabidopsis	`AT4G14410` (bHLH104) basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827086] identity=58.1; qcov=0.723; evalue=9.72e-57; confidence=high
Rice	`Os07g0543000` (OsbHLH057) - identity=43.4; qcov=0.848; evalue=3.04e-39; confidence=medium
GO	GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0006879 (intracellular iron ion homeostasis); GO:0046983 (protein dimerization activity)
KEGG	-
Pfam	PF00010 (HLH); PF23177 (bHLH_IRO3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991244

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057771338.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771338.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771338.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057771338.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057771338.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:268118`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B109
`Chr7:268169`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108
`Chr7:268172`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,D10
`Chr7:268183`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,B122,B53,C42
`Chr7:268204`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,C15
`Chr7:268213`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,C15
`Chr7:268402`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A19,B101,B14,B79,C51
`Chr7:268456`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A19,B14,B79,C51
`Chr7:268983`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B28
`Chr7:269036`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C86,D4
`Chr7:269527`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr7:269776`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B125,B28

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771338.1

231 aa

116

231

bHLH_IRO3

HLH

PF23177 bHLH_IRO3 79-166 aa PF00010 HLH 80-128 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771338.1`	Pfam	`PF23177`	bHLH_IRO3	Domain	79	166	4.1e-32	111.1	Iron-related transcription factor 3 bHLH domain
`XP_057771338.1`	Pfam	`PF00010`	HLH	Domain	80	128	2.4e-07	31.1	Helix-loop-helix DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915355.1
AATAATGTAAAATTTTGGCAATATTTCAACAAACGTGACATAATCCATCCATCTCGATCACATCCTCATAAAAAAAGCATGCAGCAACGACTTGAATCTGCAACTTGCTAGTTTTGTTAATCCAATAATTGAGTCCATCATCCTCTCACCCTGCCTCTGTTTCCGACCTCCCAAAAATCATTCCTCATTTTACCCCAAATTTTCCATCAAATTCCAAATCGATTTCTCCCAATTCTCTGTCGATGATTTCAAAGCTCGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991244
ATGCAAAATCAACACGTCCATTCCTTCACCGAGAACTGCTGGTGCGATGTAATCGATTACAGCAGCCTCCTGGACGACGACGGCGCGCCGCCGCCGGCGTTTGTTTCCGAGCGTCCGCCGCCGCCGTCGGAAATTGTTTGTATGTCAATTGATGCCACACACAGTGAAGTTACAACACTTGAGGAGAGAGGCTCCTCAAGAAAGAGGGGACGTTCTGATCAAAATGGTGGGATAGGAGCAAAAGCATGTCGTGAGAGAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771338.1
MQNQHVHSFTENCWCDVIDYSSLLDDDGAPPPAFVSERPPPPSEIVCMSIDATHSEVTTLEERGSSRKRGRSDQNGGIGAKACRERERRGKLNERFLELSAILGRERPFKTEKLAMLSDAIRLLNQLKTESMDYMEMNTRLLEEIKILKAEKNELREEKAKLKADKERIQQQLETMNIPSIGFTASHPPMYEAEVKKVPMLPSYGFVPMWQYLPPSVRDTTIDHELRPPAA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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